More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0885 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  53.6 
 
 		 699 aa  761    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.71 
 
 		 704 aa  688    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 697 aa  1425    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  47.62 
 
 		 701 aa  632  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 		 716 aa  606  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 		 826 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 852 aa  433  1e-120  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 857 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 841 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.79 
 
 		 852 aa  399  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 847 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 851 aa  317  4e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.24 
 
 		 857 aa  314  3.9999999999999997e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  27.97 
 
 		 681 aa  270  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 681 aa  267  5.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  27.71 
 
 		 686 aa  259  1e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  33.82 
 
 		 822 aa  219  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  33.67 
 
 		 849 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 409 aa  190  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  34.25 
 
 		 846 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  30.31 
 
 		 420 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  30.73 
 
 		 420 aa  163  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.25 
 
 		 981 aa  155  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  30.37 
 
 		 429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 		 1303 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  30.37 
 
 		 429 aa  149  2.0000000000000003e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  26.03 
 
 		 1499 aa  147  5e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  29.83 
 
 		 1177 aa  146  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  28.82 
 
 		 1763 aa  146  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.61 
 
 		 1765 aa  145  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.46 
 
 		 410 aa  144  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 1064 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1767 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1768 aa  142  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 1040 aa  141  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1767 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1767 aa  141  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.64 
 
 		 1033 aa  140  7e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 		 1398 aa  140  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 		 1238 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 		 1234 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3914  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1238 aa  139  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3731  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1238 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  26.54 
 
 		 1188 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1771 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 		 1238 aa  138  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 1236 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 1236 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.54 
 
 		 1236 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.83 
 
 		 1550 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 818 aa  135  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  28.46 
 
 		 1626 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.97 
 
 		 1611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1622 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1234 aa  134  5e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  28.83 
 
 		 1070 aa  134  6e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.12 
 
 		 1200 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  29.97 
 
 		 1364 aa  133  9e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.28 
 
 		 1203 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.75 
 
 		 1165 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.27 
 
 		 818 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 		 1236 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  34.71 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 929 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  27.48 
 
 		 847 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  26.32 
 
 		 1765 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.71 
 
 		 916 aa  130  7.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.13 
 
 		 1331 aa  130  8.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.94 
 
 		 1788 aa  130  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.94 
 
 		 936 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 		 1287 aa  128  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.36 
 
 		 801 aa  129  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  26.19 
 
 		 1014 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 		 833 aa  127  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.47 
 
 		 1233 aa  127  6e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.31 
 
 		 977 aa  127  7e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  33.47 
 
 		 496 aa  127  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.99 
 
 		 778 aa  127  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.77 
 
 		 1284 aa  127  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  27.39 
 
 		 647 aa  126  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1629 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1005 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.25 
 
 		 1625 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.36 
 
 		 1629 aa  125  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3018  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  25.88 
 
 		 955 aa  125  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0433784  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 1166 aa  125  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  28.05 
 
 		 977 aa  125  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 1193 aa  124  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 1245 aa  124  7e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  26.91 
 
 		 1322 aa  124  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 1182 aa  124  8e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.85 
 
 		 1784 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 		 1230 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1267 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1326 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  28.86 
 
 		 1179 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.14 
 
 		 1314 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  28.14 
 
 		 1030 aa  122  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 2654 aa  122  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>