More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0018 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
409 aa  833    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  38.56 
 
 
429 aa  249  4e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  38.56 
 
 
429 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 
826 aa  224  3e-57  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.38 
 
 
852 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
851 aa  212  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  35.21 
 
 
681 aa  209  8e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  35.14 
 
 
681 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
841 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
699 aa  204  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.78 
 
 
410 aa  203  6e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
847 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.65 
 
 
852 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  32.52 
 
 
686 aa  196  7e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 
704 aa  195  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
697 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.66 
 
 
857 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  30.34 
 
 
420 aa  182  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  29.37 
 
 
420 aa  181  2e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
716 aa  180  4e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.85 
 
 
701 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.76 
 
 
857 aa  171  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  29.09 
 
 
420 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
461 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  34.06 
 
 
461 aa  149  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  37.08 
 
 
496 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
480 aa  145  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.19 
 
 
461 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
434 aa  137  4e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  32.65 
 
 
822 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
485 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.2 
 
 
425 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  33.72 
 
 
849 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  30.15 
 
 
846 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
671 aa  88.6  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  27.94 
 
 
583 aa  82.4  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  31.97 
 
 
443 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1348  histidine kinase  27.16 
 
 
501 aa  81.3  0.00000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.515384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
475 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0282412 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.8 
 
 
823 aa  80.1  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  31.05 
 
 
589 aa  79.7  0.00000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2838  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.34 
 
 
860 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2566  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.236818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26 
 
 
466 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  30.29 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5145  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.66 
 
 
603 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
528 aa  77  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  31.69 
 
 
443 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  24.91 
 
 
410 aa  76.6  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.68 
 
 
1261 aa  76.3  0.0000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5839  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
902 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.243698  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
377 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  24.41 
 
 
468 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3236  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
900 aa  75.5  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.734401  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
612 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5361  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
897 aa  75.1  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0303077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1825  histidine kinase  24.2 
 
 
357 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
358 aa  75.5  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 
1118 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000390432  normal  0.0407868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
1330 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  24.9 
 
 
601 aa  74.7  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
359 aa  74.3  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 
566 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  29.24 
 
 
1780 aa  73.9  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
332 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  29.51 
 
 
483 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1173  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  26.12 
 
 
477 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.174496  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1852  histidine kinase  23.72 
 
 
1074 aa  73.6  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.496494  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
495 aa  73.6  0.000000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1791  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0358387  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 
475 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  29.64 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1817  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1956  sensor histidine kinase  26.67 
 
 
351 aa  73.2  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  26.36 
 
 
906 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2007  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
388 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000116465  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 
621 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1773  sensor histidine kinase  27 
 
 
347 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2436  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
888 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.747553 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.1 
 
 
815 aa  72  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4649  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
533 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2761  histidine kinase  29.92 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2991  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
894 aa  72.4  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2565  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  26.84 
 
 
902 aa  72  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4557  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
458 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.74 
 
 
750 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
1361 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6751  Osmosensitive K channel His kinase sensor  27.96 
 
 
902 aa  71.2  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 
465 aa  71.2  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
591 aa  71.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0623  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.779976  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 
524 aa  71.2  0.00000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  27.2 
 
 
465 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>