More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7077 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
480 aa  965    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  69.38 
 
 
485 aa  651    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  60.81 
 
 
496 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 
480 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  50.98 
 
 
461 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.98 
 
 
461 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  51.19 
 
 
461 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
409 aa  143  8e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  34.48 
 
 
429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  34.48 
 
 
429 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
826 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.4 
 
 
847 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  28.81 
 
 
681 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.3 
 
 
851 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
704 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  26.83 
 
 
420 aa  114  3e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  30 
 
 
686 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  26.42 
 
 
420 aa  114  5e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  34.02 
 
 
410 aa  113  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  28.27 
 
 
681 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.71 
 
 
699 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 
857 aa  106  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.36 
 
 
841 aa  103  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  29.41 
 
 
566 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  29.11 
 
 
822 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
697 aa  101  2e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
716 aa  100  7e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.38 
 
 
852 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  31.9 
 
 
587 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  31.5 
 
 
846 aa  98.2  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 
557 aa  98.2  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  33.33 
 
 
849 aa  97.8  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.05 
 
 
566 aa  97.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  30.8 
 
 
410 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  39.69 
 
 
1061 aa  95.9  1e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2392  histidine kinase  38.21 
 
 
502 aa  96.3  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  31.2 
 
 
420 aa  96.3  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  27.44 
 
 
482 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  28.19 
 
 
770 aa  95.5  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.46 
 
 
857 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
425 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
497 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  27.62 
 
 
470 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2127  histidine kinase  28.4 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  29.22 
 
 
986 aa  92.4  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 
565 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
396 aa  91.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2566  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
369 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.236818 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
453 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
571 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.23 
 
 
1021 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  28.51 
 
 
567 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
570 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  45.08 
 
 
472 aa  90.5  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  32.51 
 
 
373 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 
584 aa  90.5  6e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
373 aa  90.5  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.59 
 
 
771 aa  90.5  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
408 aa  90.1  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
714 aa  89.4  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
459 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  24.63 
 
 
453 aa  89.7  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
462 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2976  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
368 aa  89.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.598418  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
491 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  30.28 
 
 
774 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  25 
 
 
458 aa  89  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  37.88 
 
 
594 aa  88.6  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  27.43 
 
 
248 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
373 aa  89  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
434 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  32.08 
 
 
313 aa  89  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  38.33 
 
 
1062 aa  89  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  30.77 
 
 
248 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.43 
 
 
488 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.363501  normal  0.308567 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
448 aa  88.2  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
683 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
671 aa  88.2  3e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.397309  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
402 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
713 aa  87.8  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 
686 aa  87.4  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
630 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.8 
 
 
367 aa  86.7  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.78 
 
 
701 aa  87  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  28.51 
 
 
598 aa  86.7  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  29.69 
 
 
257 aa  86.7  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
488 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.09 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  28.98 
 
 
600 aa  86.3  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
516 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 
581 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 
899 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  30.2 
 
 
552 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
823 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.13 
 
 
383 aa  85.5  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>