More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3513 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
425 aa  865    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  66.18 
 
 
434 aa  534  1e-150  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  54.77 
 
 
420 aa  421  1e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  27.64 
 
 
681 aa  139  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  28.02 
 
 
686 aa  136  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.4 
 
 
410 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  27.12 
 
 
681 aa  129  8.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 
857 aa  126  8.000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.41 
 
 
852 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 
409 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
851 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
847 aa  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
857 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
841 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  25.8 
 
 
420 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  25.8 
 
 
420 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.68 
 
 
704 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 
852 aa  104  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.43 
 
 
826 aa  101  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  29.89 
 
 
496 aa  98.2  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
480 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
480 aa  94.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 
1352 aa  93.2  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
630 aa  91.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
654 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
850 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 
495 aa  89  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 
699 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 
463 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
697 aa  87.4  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
592 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2161  two component sensor histidine kinase  30.61 
 
 
481 aa  87  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.37303e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
631 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
582 aa  87  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  31.03 
 
 
734 aa  86.7  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  29.21 
 
 
461 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
850 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
461 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.44 
 
 
565 aa  86.3  9e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  29.92 
 
 
363 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.86 
 
 
848 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
412 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 
485 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
382 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  26.48 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  26.43 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  29.82 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5416  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
632 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  26.14 
 
 
822 aa  84.3  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1840  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
478 aa  84  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.105704  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
596 aa  84  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
377 aa  84  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
476 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
638 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
919 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.33 
 
 
392 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0353  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 
332 aa  84  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  33.85 
 
 
626 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
581 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  31.71 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
375 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
671 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0414779  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  29.29 
 
 
785 aa  83.2  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  28.57 
 
 
412 aa  83.2  0.000000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  29.58 
 
 
410 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  30.36 
 
 
627 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
785 aa  83.2  0.000000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
644 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.42 
 
 
627 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 
691 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 
839 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  26.1 
 
 
612 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1985  histidine kinase  30 
 
 
672 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 
375 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 
471 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5153  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1002 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437111  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3129  histidine kinase  36.18 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 
451 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2943  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  30.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  31.3 
 
 
465 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  30.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
641 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1288  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.69 
 
 
679 aa  82  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4875  PAS sensor protein  31.12 
 
 
632 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.152822  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
602 aa  82  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.02 
 
 
581 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  30.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1651  PAS sensor protein  39.1 
 
 
895 aa  81.3  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  30.49 
 
 
608 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
634 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  27.31 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
627 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
394 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.218038 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  30.89 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>