More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4382 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
644 aa  1321    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0867  ATPase domain-containing protein  34.38 
 
 
632 aa  287  4e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0932  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
632 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3404  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
632 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0958  histidine kinase  31.56 
 
 
632 aa  251  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0966  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 
632 aa  249  8e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
638 aa  211  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0214  histidine kinase  35 
 
 
657 aa  177  5e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0438  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.59 
 
 
914 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.41519  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.35 
 
 
962 aa  170  8e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1360  cellulose binding, type IV  34.67 
 
 
544 aa  169  1e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4374  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
690 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00277  Signal transduction histidine kinase (contains HAMP domain)  32.68 
 
 
560 aa  164  7e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4665  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
670 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3809  Signal transduction histidine kinase-like  26.95 
 
 
612 aa  163  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0081  histidine kinase  33.55 
 
 
529 aa  162  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.63025  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0712  putative sensor histidine kinase  31.6 
 
 
667 aa  162  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
779 aa  159  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.85917  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
693 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4495  sensory box sensor histidine kinase  33.7 
 
 
508 aa  158  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2066  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
762 aa  158  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111352  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
789 aa  158  3e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5593  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 
506 aa  157  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
781 aa  155  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2545  histidine kinase  32.29 
 
 
471 aa  155  2e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0677665 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
936 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2270  ATPase domain-containing protein  31.94 
 
 
471 aa  154  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.250434 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01214  sensor histidine kinase  33.6 
 
 
450 aa  154  5.9999999999999996e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.699466  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5000  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
893 aa  152  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.546026 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2545  ATP-binding region, ATPase-like protein  34.55 
 
 
454 aa  152  3e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1052  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
579 aa  151  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2516  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
805 aa  150  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.436888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
453 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
453 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2390  histidine kinase  34.13 
 
 
757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.534498  normal  0.927047 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
833 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2113  ATPase domain-containing protein  33.73 
 
 
757 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275639  normal  0.031966 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3787  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 
560 aa  149  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1770  histidine kinase  32.32 
 
 
778 aa  148  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1390  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
453 aa  148  3e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0606319  hitchhiker  0.00201119 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1744  Signal transduction histidine kinase  33.07 
 
 
893 aa  148  4.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.410742  normal  0.243263 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0096  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
692 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1706  histidine kinase  32.04 
 
 
444 aa  147  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1486  histidine kinase  31.03 
 
 
473 aa  147  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03441  Signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
499 aa  147  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2791  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 
1226 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.544858 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5588  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
773 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2177  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
885 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2754  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
466 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.762714  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
453 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3013  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
453 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.644967 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6050  putative sensor histidine kinase  32.04 
 
 
483 aa  145  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1492  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
453 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.609505  normal  0.551578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3685  histidine kinase  32.73 
 
 
708 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3109  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
901 aa  144  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.143082 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3162  sensor histidine kinase  32.47 
 
 
453 aa  144  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2884  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
453 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.260369  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3738  Na+/proline symporter-like protein  33.1 
 
 
950 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0664  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.56 
 
 
543 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3600  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 
900 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182555  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1306  histidine kinase  33.7 
 
 
663 aa  140  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0116699  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.69 
 
 
683 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.853209  hitchhiker  0.00641465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2525  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 
449 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0660  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
625 aa  139  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3880  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.56 
 
 
680 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2082  Signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  31.09 
 
 
436 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0339315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3384  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
898 aa  137  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0938  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
662 aa  137  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.578499  normal  0.445818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2356  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
900 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0113546  normal  0.244783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2828  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
410 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3521  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 
1237 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1667  sensor histidine kinase  26.69 
 
 
652 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.976342  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2013  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
575 aa  134  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.899017  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2473  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
550 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1018  sensory box sensor histidine kinase  28.48 
 
 
648 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
399 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3354  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
1242 aa  131  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4414  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1781  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system-like protein  33.33 
 
 
454 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000350892  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4005  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
545 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000706341 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2962  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
729 aa  128  4.0000000000000003e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0736  ATPase domain-containing protein  31.53 
 
 
543 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000490957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3225  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
543 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000746218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0764  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 
543 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.757334  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0993  ligand-binding sensor domain-containing protein  30.24 
 
 
1250 aa  124  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3894  sensor histidine kinase  31.08 
 
 
543 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3335  histidine kinase  27.63 
 
 
464 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4148  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
546 aa  122  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.621708 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1964  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
427 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00543356  normal  0.092514 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1205  sensor histidine kinase  31.14 
 
 
580 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0779  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0612019  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0543  ATP-binding region, ATPase-like protein  29.79 
 
 
534 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
594 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0505  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 
530 aa  113  9e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.903517  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  32.25 
 
 
482 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
919 aa  113  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  30 
 
 
600 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
611 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>