More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4094 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  100 
 
 		 612 aa  1264    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  42.57 
 
 		 651 aa  481  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  41.44 
 
 		 614 aa  315  9.999999999999999e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  30.46 
 
 		 511 aa  260  4e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  45.74 
 
 		 456 aa  261  4e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  36.77 
 
 		 532 aa  243  9e-63  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.2 
 
 		 528 aa  224  3e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  41.89 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  43.32 
 
 		 479 aa  197  7e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  38.46 
 
 		 416 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 422 aa  170  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  33.57 
 
 		 478 aa  160  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 452 aa  156  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  32.4 
 
 		 498 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  33.57 
 
 		 303 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  36.64 
 
 		 406 aa  150  9e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  34.9 
 
 		 451 aa  145  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  35.04 
 
 		 479 aa  145  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  35.11 
 
 		 422 aa  144  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  35.47 
 
 		 458 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  33.48 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  33.47 
 
 		 391 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 458 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 394 aa  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  33.05 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  31.93 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  34.19 
 
 		 458 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.95 
 
 		 392 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  36.25 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 		 554 aa  137  6.0000000000000005e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 582 aa  135  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  30.36 
 
 		 910 aa  134  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 584 aa  134  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  33.75 
 
 		 587 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.75 
 
 		 587 aa  134  6e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 514 aa  134  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 584 aa  133  7.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  32.78 
 
 		 393 aa  133  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  34.06 
 
 		 409 aa  133  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 600 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  32.1 
 
 		 467 aa  132  2.0000000000000002e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  30.47 
 
 		 387 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 587 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 815 aa  132  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.25 
 
 		 1274 aa  131  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 585 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02680  histidine kinase  32.91 
 
 		 416 aa  130  7.000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4321  histidine kinase  32.64 
 
 		 461 aa  130  8.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.332203  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.92 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  32.92 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  33.75 
 
 		 587 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  33.05 
 
 		 464 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  32.92 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  32.92 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 652 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  32.92 
 
 		 587 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  34.48 
 
 		 885 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  33.75 
 
 		 587 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 617 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4476  histidine kinase  32.64 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0860551  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4457  histidine kinase  32.64 
 
 		 461 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  30.08 
 
 		 465 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  32.22 
 
 		 257 aa  128  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 		 489 aa  128  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3227  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 890 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  31.36 
 
 		 412 aa  127  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 589 aa  127  7e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 		 350 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  30.89 
 
 		 382 aa  127  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  31.66 
 
 		 311 aa  127  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  30.51 
 
 		 397 aa  127  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  31.25 
 
 		 392 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  31.25 
 
 		 392 aa  127  8.000000000000001e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 639 aa  127  9e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.78 
 
 		 537 aa  126  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 300 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1352 aa  126  1e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0653  histidine kinase  32.64 
 
 		 397 aa  126  1e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.320016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  30.64 
 
 		 401 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  30.54 
 
 		 392 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10498  two component system sensor histidine kinase senX3  31.33 
 
 		 410 aa  125  2e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.19354e-61  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.51 
 
 		 539 aa  125  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.6 
 
 		 452 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 591 aa  126  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2605  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 892 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 589 aa  124  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1224  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 889 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  30.04 
 
 		 551 aa  124  6e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 		 597 aa  124  7e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 307 aa  124  7e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11680  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 496 aa  123  8e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.889149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  33.75 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 		 646 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>