More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0202 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 
614 aa  1253    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  41.44 
 
 
612 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  31.63 
 
 
651 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  42.46 
 
 
511 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  44.17 
 
 
456 aa  250  5e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.4 
 
 
528 aa  233  5e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  36.39 
 
 
532 aa  222  9.999999999999999e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  32.9 
 
 
416 aa  211  4e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
422 aa  187  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  34.39 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  37.08 
 
 
303 aa  181  4e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  39.92 
 
 
463 aa  177  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  36.76 
 
 
478 aa  164  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  30.97 
 
 
498 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
452 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
458 aa  137  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
537 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
458 aa  137  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.14 
 
 
406 aa  136  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  34.39 
 
 
451 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  33.19 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  34.06 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  34.93 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  28.73 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  33.62 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
592 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  34.5 
 
 
458 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
458 aa  134  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  31.06 
 
 
391 aa  134  6e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  33.19 
 
 
458 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  32.27 
 
 
467 aa  133  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
489 aa  133  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  30.62 
 
 
412 aa  131  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
624 aa  132  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.19 
 
 
444 aa  131  4.0000000000000003e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  30.87 
 
 
409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0820  multisensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 
519 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
453 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  30.77 
 
 
586 aa  130  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
815 aa  130  8.000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
564 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  30.9 
 
 
551 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 
458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  29.27 
 
 
555 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
607 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  29.39 
 
 
422 aa  128  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  32.62 
 
 
347 aa  128  3e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  29.06 
 
 
382 aa  128  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
600 aa  127  5e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3938  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 
350 aa  126  9e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
418 aa  126  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.98 
 
 
587 aa  126  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  32.52 
 
 
613 aa  126  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
1010 aa  126  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
412 aa  126  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  28.51 
 
 
311 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
591 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
584 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
584 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  32.43 
 
 
466 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.98 
 
 
587 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  28.63 
 
 
465 aa  125  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 
589 aa  125  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
604 aa  125  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
394 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 
583 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 
307 aa  125  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  32.5 
 
 
583 aa  125  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
611 aa  124  4e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  34.5 
 
 
356 aa  124  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
466 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  31.98 
 
 
587 aa  124  4e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  28.63 
 
 
425 aa  124  4e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
412 aa  124  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1599  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 
556 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.928385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  30.47 
 
 
465 aa  124  5e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  27.8 
 
 
414 aa  124  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.58 
 
 
587 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  32.05 
 
 
508 aa  124  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0960  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.63 
 
 
397 aa  124  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.874918  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0259  histidine kinase  29.96 
 
 
518 aa  124  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.10372  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  29.06 
 
 
415 aa  124  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  6e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
585 aa  124  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  7e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.58 
 
 
587 aa  124  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
582 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
300 aa  123  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  28.62 
 
 
613 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0429  ATP-binding region ATPase domain protein  32.38 
 
 
568 aa  122  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.796172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
827 aa  122  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  28.42 
 
 
300 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
639 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>