More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0208 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  100 
 
 		 532 aa  1077    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  42.15 
 
 		 511 aa  412  1e-114  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.15 
 
 		 528 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  36.77 
 
 		 612 aa  243  7.999999999999999e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  36.77 
 
 		 456 aa  239  6.999999999999999e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  33.25 
 
 		 651 aa  232  1e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  36.39 
 
 		 614 aa  222  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  36.43 
 
 		 416 aa  190  7e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  38.95 
 
 		 479 aa  177  4e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  38.59 
 
 		 463 aa  164  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  34.93 
 
 		 478 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  32.97 
 
 		 303 aa  158  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 		 1043 aa  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 600 aa  147  5e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 		 589 aa  143  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 815 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  27.43 
 
 		 392 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 489 aa  140  4.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 584 aa  140  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 584 aa  140  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  32.61 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 		 581 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  30.82 
 
 		 479 aa  139  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  32.02 
 
 		 451 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  28.99 
 
 		 498 aa  138  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 585 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 		 422 aa  137  6.0000000000000005e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  30.25 
 
 		 537 aa  137  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 571 aa  136  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  31.8 
 
 		 467 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 460 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 		 607 aa  135  3e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  30.67 
 
 		 669 aa  134  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 623 aa  133  7.999999999999999e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 582 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.28 
 
 		 508 aa  133  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 592 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  30.26 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  32.77 
 
 		 398 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 639 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1072  histidine kinase  30.17 
 
 		 354 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  29.05 
 
 		 613 aa  132  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 		 473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 611 aa  131  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 885 aa  131  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.45 
 
 		 587 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.45 
 
 		 587 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 619 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 418 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  29.79 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  30.7 
 
 		 422 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 587 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  32.77 
 
 		 713 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4924  histidine kinase  30.36 
 
 		 443 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.543055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 1039 aa  129  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.87 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 		 307 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 1042 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 444 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 300 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 		 587 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  31.47 
 
 		 539 aa  127  5e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 737 aa  127  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.4 
 
 		 598 aa  127  6e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  29.8 
 
 		 419 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 639 aa  127  6e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 412 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  28.7 
 
 		 257 aa  126  8.000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 377 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 641 aa  126  9e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 613 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  31.67 
 
 		 300 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  28.74 
 
 		 451 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  126  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 639 aa  126  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 		 453 aa  126  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 763 aa  125  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.63 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.63 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  30.32 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.46 
 
 		 458 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.63 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  30.32 
 
 		 613 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 621 aa  125  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.63 
 
 		 587 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 316 aa  125  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>