More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0508 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 316 aa  642    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.61 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  54.66 
 
 		 318 aa  376  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.34 
 
 		 318 aa  374  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  55.41 
 
 		 341 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  55.02 
 
 		 329 aa  360  2e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.9 
 
 		 314 aa  351  8e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  46.39 
 
 		 320 aa  275  9e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  35.85 
 
 		 344 aa  178  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  30.6 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  36.08 
 
 		 278 aa  145  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  34 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 410 aa  138  1e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 		 475 aa  135  9e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 460 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 905 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 815 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  32.82 
 
 		 372 aa  133  3.9999999999999996e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 		 592 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 587 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 		 633 aa  129  7.000000000000001e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.3 
 
 		 587 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.3 
 
 		 587 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.3 
 
 		 587 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.3 
 
 		 587 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.3 
 
 		 587 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.89 
 
 		 587 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.89 
 
 		 587 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 585 aa  126  5e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  125  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.49 
 
 		 587 aa  125  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  31.25 
 
 		 532 aa  125  9e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0236  osmosensitive K channel His kinase sensor  35.17 
 
 		 905 aa  124  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0950  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 		 902 aa  124  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  33.47 
 
 		 662 aa  124  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 		 581 aa  123  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 615 aa  123  3e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0181  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 		 905 aa  124  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 585 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 322 aa  123  4e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  35.29 
 
 		 905 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.48 
 
 		 539 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 606 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 582 aa  122  8e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 355 aa  121  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 602 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  31.27 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 		 491 aa  120  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0255402  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  34.36 
 
 		 508 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 608 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 591 aa  119  6e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2938  ATPase domain-containing protein  33.93 
 
 		 361 aa  119  7e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0197  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 		 907 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262626  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  33.05 
 
 		 565 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 589 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2133  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 678 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 528 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  33.06 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 885 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 554 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 623 aa  117  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 		 359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 621 aa  116  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 593 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 607 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 590 aa  115  8.999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  32.5 
 
 		 392 aa  115  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4166  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.8 
 
 		 445 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0754013 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 600 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3779  Osmosensitive K channel His kinase sensor  35.14 
 
 		 857 aa  114  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135978  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  31.05 
 
 		 589 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  31.45 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  34.38 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  31.84 
 
 		 478 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 466 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.87 
 
 		 406 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.55 
 
 		 584 aa  114  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 470 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3779  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 912 aa  114  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 		 571 aa  114  3e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  33.48 
 
 		 975 aa  114  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3410  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 907 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  30.9 
 
 		 497 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 958 aa  113  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  32.11 
 
 		 591 aa  113  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0395  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 		 509 aa  113  5e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 609 aa  113  5e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 517 aa  112  6e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2527  histidine kinase  31.87 
 
 		 535 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0731082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  31.9 
 
 		 713 aa  112  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 640 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  32.52 
 
 		 1111 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0792  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 476 aa  112  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0106036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 300 aa  112  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 597 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 584 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 1629 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  29.6 
 
 		 446 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>