More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3822 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  100 
 
 		 322 aa  650    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 302 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 545 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.595056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  34.62 
 
 		 332 aa  135  7.000000000000001e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 329 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  33.47 
 
 		 341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 410 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 316 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  31.36 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  31.54 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  28.57 
 
 		 318 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 300 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 571 aa  110  3e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.151303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.56 
 
 		 321 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 307 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  31.82 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  28.81 
 
 		 278 aa  109  8.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  31 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1766  sensor histidine kinase  35.61 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00053599  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 815 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  29.1 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  28.96 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  32.37 
 
 		 392 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  27.73 
 
 		 458 aa  103  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  31.49 
 
 		 662 aa  103  3e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 546 aa  103  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  29.07 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  28 
 
 		 406 aa  102  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0957  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000080857  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0865  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.136133  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0476  phosphate regulon sensor protein  30.08 
 
 		 431 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0829  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000370117  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1571  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00000849213  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  101  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2767  histidine protein kinase PhoR  32.6 
 
 		 436 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0684991  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0719  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.88 
 
 		 463 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  27.11 
 
 		 458 aa  100  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  33.62 
 
 		 257 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4357  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  100  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000114485  unclonable  0.00000640449 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0049  sensor histidine kinase  34.15 
 
 		 459 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000331015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  28.05 
 
 		 458 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0571  histidine protein kinase PhoR  33.95 
 
 		 448 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0483305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  29.65 
 
 		 551 aa  100  4e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 458 aa  100  4e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0786  histidine protein kinase PhoR  34.11 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0580  histidine protein kinase PhoR  34.11 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.211794  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1491  phosphate regulon sensor protein PhoR  34.11 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.690525  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1297  histidine protein kinase PhoR  34.11 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  27.6 
 
 		 458 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0430  phosphate regulon sensor protein  30.2 
 
 		 431 aa  99.8  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 534 aa  99.8  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1397  Signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 513 aa  99.8  6e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000010063  hitchhiker  4.02057e-23 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4874  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 458 aa  99.8  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000686699  hitchhiker  0.00000000293708 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6071  two component sensor kinase  31.02 
 
 		 902 aa  99.4  7e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0319  phosphate regulon sensor protein  30.2 
 
 		 431 aa  99.4  8e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 892 aa  99.4  8e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 415 aa  99.4  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.86 
 
 		 321 aa  99  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 412 aa  98.6  1e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00348  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with PhoB  30.2 
 
 		 431 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 401 aa  97.8  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00352  hypothetical protein  30.2 
 
 		 431 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1625  phosphate regulon sensor protein phoR  33.64 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  30.28 
 
 		 451 aa  97.8  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1522  phosphate regulon sensor protein PhoR  33.64 
 
 		 436 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3902  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1492  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 624 aa  97.8  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.411872  decreased coverage  0.00494446 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3209  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 		 701 aa  97.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2630  two component sensor histidine kinase  30.21 
 
 		 555 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0428  phosphate regulon sensor protein  29.8 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 556 aa  97.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  25.44 
 
 		 614 aa  97.4  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0468  phosphate regulon sensor protein  29.8 
 
 		 431 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 		 470 aa  96.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3233  phosphate regulon sensor protein  29.8 
 
 		 431 aa  97.1  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.62554  unclonable  0.0000000115446 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 456 aa  97.1  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2207  sensor kinase protein  33.82 
 
 		 1093 aa  97.1  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000125759  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1872  histidine kinase  29.15 
 
 		 482 aa  97.1  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3968  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 526 aa  97.1  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.179224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.05 
 
 		 489 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1535  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 459 aa  97.1  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.896315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 		 763 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 		 2153 aa  96.7  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0924  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 664 aa  96.7  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.38 
 
 		 585 aa  96.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2428  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.71 
 
 		 945 aa  96.7  5e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.396366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0906  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 528 aa  95.9  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 		 885 aa  96.3  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0775  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.41 
 
 		 449 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.82168  normal  0.228948 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  32.09 
 
 		 571 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  33.03 
 
 		 571 aa  95.9  9e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  29.36 
 
 		 397 aa  95.9  9e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  27.43 
 
 		 589 aa  95.5  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 		 718 aa  95.1  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>