More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1292 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  100 
 
 		 341 aa  694    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  70.06 
 
 		 329 aa  476  1e-133  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.49 
 
 		 318 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  58.18 
 
 		 318 aa  394  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.06 
 
 		 321 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.41 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.94 
 
 		 314 aa  318  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  50.32 
 
 		 320 aa  290  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  34.81 
 
 		 344 aa  169  9e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  30.75 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.84 
 
 		 410 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  33.08 
 
 		 332 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  34.25 
 
 		 278 aa  130  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  31.76 
 
 		 372 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  33.47 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 581 aa  120  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  36.2 
 
 		 503 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 466 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  31.25 
 
 		 532 aa  118  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  30.86 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.78 
 
 		 462 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  29.33 
 
 		 456 aa  116  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.66 
 
 		 300 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2337  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 564 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139979  normal  0.523633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 528 aa  114  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 475 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 633 aa  114  2.0000000000000002e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  31.43 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 583 aa  114  3e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13150  histidine kinase  32.83 
 
 		 436 aa  113  4.0000000000000004e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  29.97 
 
 		 406 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 596 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.82 
 
 		 463 aa  113  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 484 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 484 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.45 
 
 		 602 aa  112  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.085128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 484 aa  112  9e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 461 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 484 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.89 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  31.3 
 
 		 484 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1272  phosphate sensor signal transduction histidine kinase, PhoR  30.47 
 
 		 437 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.54553  normal  0.265376 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2666  histidine kinase  33.76 
 
 		 586 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0592074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  32.11 
 
 		 398 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 484 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  30.62 
 
 		 511 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  31.14 
 
 		 392 aa  111  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0155  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 462 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 815 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.43 
 
 		 591 aa  110  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 584 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 446 aa  110  3e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 		 611 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 437 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 584 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 602 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  28.38 
 
 		 463 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 582 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 484 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  33.91 
 
 		 257 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  33.91 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30.87 
 
 		 484 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  29.64 
 
 		 415 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 513 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 462 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  31.25 
 
 		 466 aa  108  1e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 480 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0205  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 		 905 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0504011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 		 510 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.94557  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 608 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  30.84 
 
 		 449 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 307 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0746  histidine kinase  29.31 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000736417  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0568  histidine kinase  30.17 
 
 		 669 aa  108  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 457 aa  107  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  28.05 
 
 		 589 aa  107  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0649  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 481 aa  107  3e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.04 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2598  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 469 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.833045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.67 
 
 		 587 aa  107  3e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0288  histidine kinase  31.74 
 
 		 432 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000409515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 585 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.71 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  30.13 
 
 		 412 aa  107  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.24 
 
 		 585 aa  107  4e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  32.08 
 
 		 662 aa  107  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0483028 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>