More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3873 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 513 aa  1041    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  41.58 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  41.58 
 
 		 484 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  41.58 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  41.58 
 
 		 484 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 484 aa  340  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  41.18 
 
 		 484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  40.16 
 
 		 484 aa  339  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  40.37 
 
 		 484 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  33.88 
 
 		 479 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  38.11 
 
 		 352 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  37.5 
 
 		 389 aa  212  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 		 490 aa  207  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118396  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  34.94 
 
 		 385 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 413 aa  182  8.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  35.06 
 
 		 466 aa  183  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 466 aa  182  1e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  34.52 
 
 		 466 aa  182  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  34.34 
 
 		 466 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  34.74 
 
 		 466 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  34.82 
 
 		 468 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  34.54 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  30 
 
 		 463 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 459 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 471 aa  175  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 611 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  37.83 
 
 		 613 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.5 
 
 		 463 aa  173  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 462 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 		 487 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  29.43 
 
 		 463 aa  171  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  30.36 
 
 		 461 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  27.83 
 
 		 463 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  28.77 
 
 		 463 aa  169  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  37.28 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  37.28 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 480 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  37.28 
 
 		 613 aa  169  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 471 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.26 
 
 		 456 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  37.28 
 
 		 613 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  33.23 
 
 		 455 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.23 
 
 		 508 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 613 aa  167  4e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 613 aa  167  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  36.84 
 
 		 613 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  36.84 
 
 		 613 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0272  sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 340 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0316  putative sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 337 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 468 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0286  sensor histidine kinase  36.08 
 
 		 314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  31.31 
 
 		 503 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 		 619 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 		 600 aa  166  8e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 340 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4751  sensor histidine kinase  31.08 
 
 		 483 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 723 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5253  sensory transduction protein  32.21 
 
 		 481 aa  164  3e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  29.66 
 
 		 463 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 458 aa  163  6e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 493 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 		 524 aa  163  7e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 		 608 aa  163  8.000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4800  sensory transduction protein  31.88 
 
 		 502 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0181397  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0284  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 		 468 aa  163  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0303  histidine kinase  30.82 
 
 		 360 aa  162  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 		 359 aa  161  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 608 aa  161  3e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 504 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 592 aa  160  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  30.06 
 
 		 482 aa  160  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 		 457 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.35 
 
 		 512 aa  159  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0257  sensor histidine kinase  34.62 
 
 		 340 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4665  histidine kinase  31.31 
 
 		 502 aa  158  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 470 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4999  putative sensor histidine kinase  36.16 
 
 		 337 aa  158  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.938877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.33 
 
 		 463 aa  157  3e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.44 
 
 		 609 aa  157  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 607 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0250  histidine kinase  30.74 
 
 		 501 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.162679  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 466 aa  157  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 		 473 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.04 
 
 		 462 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  36.89 
 
 		 537 aa  157  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2597  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.12 
 
 		 354 aa  156  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.016689  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  32.3 
 
 		 464 aa  156  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.27 
 
 		 493 aa  156  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.990632  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 		 383 aa  155  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.722715 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0118  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 381 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000583665  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0804  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 358 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0113  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.741915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 596 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>