More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_3068 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_3068  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
479 aa  969    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000279575  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2920  histidine kinase  45.93 
 
 
479 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
484 aa  312  6.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
484 aa  309  5.9999999999999995e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  39.46 
 
 
484 aa  309  6.999999999999999e-83  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  38.43 
 
 
484 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  39.26 
 
 
484 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  37.76 
 
 
484 aa  297  2e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 
513 aa  279  7e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  35.87 
 
 
389 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  36.48 
 
 
352 aa  196  7e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  35.83 
 
 
385 aa  190  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.118396  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.89 
 
 
503 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
470 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000145863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
471 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
471 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
458 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
473 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1287  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
504 aa  162  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000512156  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1455  histidine kinase  29.67 
 
 
467 aa  160  3e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00585199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.29 
 
 
508 aa  161  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0324  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 
480 aa  160  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
600 aa  160  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4664  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 
413 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2521  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
457 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
466 aa  159  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1216  histidine kinase  31.2 
 
 
466 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
459 aa  156  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 
607 aa  155  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  33.24 
 
 
466 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  33.24 
 
 
466 aa  154  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  33.24 
 
 
466 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  33.24 
 
 
466 aa  154  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  35.15 
 
 
466 aa  153  7e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  33.43 
 
 
466 aa  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  35.15 
 
 
466 aa  153  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  25.05 
 
 
540 aa  153  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  32.27 
 
 
466 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
597 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
621 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
639 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2496  sensor histidine kinase  31.21 
 
 
469 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
597 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  31.98 
 
 
466 aa  149  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
590 aa  149  9e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  28.28 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
590 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
639 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
639 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 
641 aa  147  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  29.02 
 
 
468 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  32.59 
 
 
455 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.06 
 
 
608 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
463 aa  147  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000121964  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
620 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2217  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.92 
 
 
446 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0952  histidine kinase  27.54 
 
 
482 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.483334 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
591 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0546  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
462 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1547  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
613 aa  145  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
701 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
614 aa  144  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
609 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 
468 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0779  sensor histidine kinase  26.17 
 
 
463 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
467 aa  144  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2723  sensor histidine kinase  28.67 
 
 
482 aa  144  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
640 aa  143  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  26.05 
 
 
463 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.75 
 
 
346 aa  143  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.9 
 
 
462 aa  143  7e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
585 aa  143  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  143  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4440  histidine kinase  31.85 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  27.79 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2657  histidine kinase  31.51 
 
 
362 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  27.79 
 
 
458 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2122  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.54 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
456 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C62  Signal transduction histidine kinase  32.28 
 
 
464 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
611 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
621 aa  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 
608 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.71 
 
 
463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
592 aa  140  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.9 
 
 
456 aa  140  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  33.77 
 
 
613 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0254  sensor histidine kinase  31.97 
 
 
340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  27.79 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  27.79 
 
 
458 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
422 aa  140  3.9999999999999997e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  29.17 
 
 
496 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  27.74 
 
 
463 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  34.2 
 
 
587 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>