More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4169 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
302 aa  607  1e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  38.22 
 
 
329 aa  159  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  34.87 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  34.36 
 
 
341 aa  145  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
318 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  34.75 
 
 
318 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 
307 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  33.56 
 
 
300 aa  143  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
815 aa  142  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 
314 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  32.56 
 
 
311 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
321 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  33.61 
 
 
332 aa  130  3e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
600 aa  129  6e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  34.17 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
444 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
475 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 
581 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
458 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  31.62 
 
 
412 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
584 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  34.66 
 
 
415 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
584 aa  123  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  32.21 
 
 
456 aa  123  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  32.2 
 
 
382 aa  123  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4045  ATPase domain-containing protein  37.5 
 
 
384 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  40.74 
 
 
455 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 
607 aa  122  9e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15021  two-component sensor histidine kinase  33.46 
 
 
689 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.1145  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  32.63 
 
 
406 aa  121  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0118  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
415 aa  120  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.26579 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  35.53 
 
 
446 aa  120  3e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  35.44 
 
 
393 aa  120  3.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.46 
 
 
637 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
599 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  34.03 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  34.32 
 
 
409 aa  119  4.9999999999999996e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 
608 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  34.16 
 
 
425 aa  119  6e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0588  Signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
326 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0132026  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
585 aa  119  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  31.97 
 
 
685 aa  119  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
612 aa  118  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2503  sensor histidine kinase  35.86 
 
 
471 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0177  histidine kinase  35.29 
 
 
407 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.450001  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  32.35 
 
 
587 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  33.08 
 
 
688 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.53 
 
 
584 aa  117  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0496  phosphate regulon sensor kinase PhoR  34.13 
 
 
419 aa  116  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.27503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  35.48 
 
 
414 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  31.34 
 
 
278 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  31.93 
 
 
587 aa  116  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  32.63 
 
 
422 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  34.87 
 
 
398 aa  116  5e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
587 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0167  histidine kinase  34.45 
 
 
407 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.114642  normal  0.326562 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
827 aa  115  7.999999999999999e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0553  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
321 aa  115  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.234354 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15421  two-component sensor histidine kinase  32.7 
 
 
688 aa  115  8.999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.137476  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.93 
 
 
587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0550  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.21 
 
 
696 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472328  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2209  sensor histidine kinase HpkA  34.6 
 
 
471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  35.25 
 
 
392 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.93 
 
 
587 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  31.51 
 
 
587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  31.51 
 
 
587 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0012  histidine kinase  35 
 
 
424 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61719  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  31.51 
 
 
587 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  31.51 
 
 
587 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  31.51 
 
 
587 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
526 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  34.58 
 
 
257 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  33.76 
 
 
423 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  34.93 
 
 
449 aa  113  4.0000000000000004e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
437 aa  113  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0308892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
438 aa  112  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0666  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
917 aa  112  5e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.220304  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
1153 aa  112  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1749  ATPase domain-containing protein  35.93 
 
 
602 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.181341  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
596 aa  112  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
563 aa  112  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
625 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  31.91 
 
 
391 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  32.1 
 
 
689 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  32.93 
 
 
458 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  34.09 
 
 
346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  30.71 
 
 
662 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 
608 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  32.1 
 
 
689 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 
885 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  31.76 
 
 
397 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13951  two-component sensor histidine kinase  33.21 
 
 
686 aa  110  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0290244  normal  0.899353 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
582 aa  110  3e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  31.15 
 
 
372 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
356 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
418 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
458 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>