More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3618 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
314 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  58.9 
 
 
316 aa  385  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  54.19 
 
 
329 aa  348  9e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1292  histidine kinase  51.94 
 
 
341 aa  344  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00188773  hitchhiker  0.0000922476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1343  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.58 
 
 
318 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.369985  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2941  histidine kinase  52.26 
 
 
318 aa  342  2.9999999999999997e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.28 
 
 
321 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3147  two component signal sensor histidine kinase  49.19 
 
 
320 aa  276  4e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4169  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.8 
 
 
302 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.429609 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  31.03 
 
 
344 aa  143  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0623  histidine kinase  29.59 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0443  Signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
475 aa  131  1.0000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3447  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 
278 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.733852  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
633 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
528 aa  122  8e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
410 aa  122  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  29.88 
 
 
332 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  32.81 
 
 
372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
591 aa  116  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3822  ATP-binding region ATPase domain protein  32.3 
 
 
322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.216218  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  28.46 
 
 
532 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0706  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
611 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.174577  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
737 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  32.95 
 
 
392 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.02 
 
 
584 aa  112  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  33.04 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  32.93 
 
 
311 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  33.04 
 
 
415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  27.61 
 
 
610 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 
458 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  29.91 
 
 
446 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.53 
 
 
460 aa  110  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  28.97 
 
 
406 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
609 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.04 
 
 
539 aa  109  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 
640 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
478 aa  109  6e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0313  ATPase domain-containing protein  29.64 
 
 
363 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0134516  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 
307 aa  108  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  27.61 
 
 
608 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4321  histidine kinase  32.58 
 
 
391 aa  108  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.61 
 
 
608 aa  108  9.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  31.63 
 
 
565 aa  108  1e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6335  sensory histidine kinase in two-component regulatory system wtih KdpE, regulation of potassium translocation  33.78 
 
 
905 aa  108  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0342372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
489 aa  108  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 
300 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3614  ATPase domain-containing protein  32.46 
 
 
662 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0483028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  33.77 
 
 
382 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2265  histidine kinase  31.97 
 
 
429 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.19602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  31.36 
 
 
554 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3873  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
513 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.124694  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
701 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
596 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1889  histidine kinase  33.19 
 
 
476 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.984041  normal  0.410021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0803  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
399 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
554 aa  108  2e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 
611 aa  107  2e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  34.98 
 
 
478 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
621 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 
623 aa  108  2e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
524 aa  108  2e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
444 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
815 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.79 
 
 
608 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  33.59 
 
 
300 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  31.06 
 
 
448 aa  107  4e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  31.44 
 
 
387 aa  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
581 aa  107  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
827 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  34.06 
 
 
423 aa  106  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  29.13 
 
 
614 aa  105  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1731  Signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
366 aa  105  8e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000205849  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
484 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
484 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
484 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  29.46 
 
 
587 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
484 aa  105  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  27.24 
 
 
511 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  29.36 
 
 
484 aa  105  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
423 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.149511  hitchhiker  0.00271132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  29.46 
 
 
587 aa  105  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
466 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 
514 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  29.05 
 
 
587 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
465 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
582 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
718 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  32.16 
 
 
535 aa  104  2e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2560  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
518 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.315276 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  29.8 
 
 
478 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
885 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0660  histidine kinase  31.28 
 
 
392 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  30.37 
 
 
422 aa  103  3e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  30.34 
 
 
613 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0673  histidine kinase  31.28 
 
 
392 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.692637 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2317  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
431 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.837858  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0653  histidine kinase  31.28 
 
 
392 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.550113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4387  sensor histidine kinase  29.53 
 
 
500 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  29.05 
 
 
587 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 
422 aa  103  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>