More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4969 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
422 aa  849    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  32.23 
 
 
416 aa  250  3e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  32.35 
 
 
614 aa  200  3e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  30.89 
 
 
651 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  31.93 
 
 
612 aa  179  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 
528 aa  174  1.9999999999999998e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  27.9 
 
 
456 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  31.94 
 
 
498 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  29.18 
 
 
532 aa  150  5e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  30.86 
 
 
511 aa  147  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  36.91 
 
 
479 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  33.62 
 
 
463 aa  145  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  33.82 
 
 
303 aa  141  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
551 aa  125  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
452 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  33.06 
 
 
451 aa  123  8e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  28.36 
 
 
479 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  28.57 
 
 
478 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  33.47 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  23.58 
 
 
397 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0366  ATP-binding region ATPase domain protein  30.83 
 
 
555 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
815 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
582 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 
592 aa  114  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.13 
 
 
584 aa  114  4.0000000000000004e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1022  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 
459 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  23.68 
 
 
392 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1401  histidine kinase  25.31 
 
 
372 aa  113  8.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.117911 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2970  histidine kinase  26.18 
 
 
387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1142 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2670  histidine kinase  26.96 
 
 
352 aa  111  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  27.31 
 
 
382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
584 aa  110  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0508  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 
316 aa  110  5e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 
584 aa  110  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2483  sensor histidine kinase KdpD  23.84 
 
 
885 aa  109  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0913  sensory histidine kinase CreC  25.51 
 
 
483 aa  109  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 
590 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5486  sensory histidine kinase CreC  25.91 
 
 
483 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.305931 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
300 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
592 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3570  sensory histidine kinase CreC  25.91 
 
 
483 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0265926  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1348  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
555 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.801088  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4797  sensory histidine kinase CreC  25.91 
 
 
483 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
555 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.29 
 
 
552 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.470241 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
581 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  26.87 
 
 
539 aa  107  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
589 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  28.26 
 
 
906 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.03 
 
 
591 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2987  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 
410 aa  107  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.472941  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
585 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1753  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
547 aa  107  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408385  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  28.25 
 
 
537 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
608 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  25 
 
 
311 aa  106  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4711  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.79 
 
 
551 aa  106  6e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00848915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.58 
 
 
460 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.04 
 
 
307 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
377 aa  106  9e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
619 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  26.04 
 
 
300 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1414  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2915  two-component sensor histidine kinase  25.1 
 
 
346 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  25.94 
 
 
470 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2288  histidine kinase  24.47 
 
 
346 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.677673  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1559  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
346 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.306197  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1454  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  105  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3618  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
314 aa  104  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  25.43 
 
 
591 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1352  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  104  3e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.39 
 
 
585 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
471 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  25.21 
 
 
415 aa  104  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3992  sensor histidine kinase  28.96 
 
 
466 aa  104  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
468 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  22.31 
 
 
423 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1214  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.391759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1192  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4666  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
514 aa  104  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.782496  normal  0.233494 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 
652 aa  103  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1313  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  104  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1390  sensor histidine kinase  26.48 
 
 
466 aa  104  4e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  23.83 
 
 
412 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
350 aa  103  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
889 aa  103  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
596 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1270  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 
405 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3543  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  24.62 
 
 
478 aa  103  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3795  histidine kinase  24.32 
 
 
725 aa  103  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.421724 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31890  signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
394 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1878  sensor histidine kinase  26.62 
 
 
329 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000152464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
459 aa  103  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  25.11 
 
 
257 aa  103  7e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1923  histidine kinase  26.79 
 
 
468 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03690  histidine kinase  23.83 
 
 
398 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.156811 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 
457 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
401 aa  103  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.46 
 
 
600 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>