More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4520 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
452 aa  907    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  34.55 
 
 
467 aa  227  3e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  30.91 
 
 
498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  35.23 
 
 
532 aa  169  8e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  33.33 
 
 
456 aa  166  9e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  29.69 
 
 
612 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  34.05 
 
 
511 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
528 aa  162  9e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  30.9 
 
 
651 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  36.88 
 
 
463 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  32.79 
 
 
416 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  32.12 
 
 
614 aa  150  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  36.6 
 
 
479 aa  144  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  33.46 
 
 
479 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.09 
 
 
422 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  30.89 
 
 
303 aa  121  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
587 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.96 
 
 
587 aa  119  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  31.38 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  31.38 
 
 
587 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  30.96 
 
 
587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 
587 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.96 
 
 
587 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.96 
 
 
587 aa  118  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
815 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.96 
 
 
587 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  30.96 
 
 
587 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  29.13 
 
 
539 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3104  histidine protein kinase PhoR  28.7 
 
 
438 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0547463  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
587 aa  114  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  28.95 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
554 aa  112  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2640  sensor histidine kinase  32.74 
 
 
310 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2326  sensor protein yycg  32.74 
 
 
473 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
582 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  30.43 
 
 
1274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
456 aa  111  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  30.47 
 
 
392 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  26.92 
 
 
478 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  26.69 
 
 
565 aa  110  5e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
597 aa  110  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  28.33 
 
 
584 aa  110  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2084  histidine kinase  29.57 
 
 
393 aa  110  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.115091  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
445 aa  110  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3739  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
379 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
473 aa  109  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  29.87 
 
 
465 aa  109  1e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 
1516 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  30.77 
 
 
382 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
607 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0720  sensory box histidine kinase  30.77 
 
 
449 aa  108  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2551  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
401 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.203481  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
620 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3018  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.75 
 
 
471 aa  107  3e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
581 aa  107  3e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3032  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.98 
 
 
509 aa  107  4e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.446581  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0410  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
300 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
307 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 
597 aa  107  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.44 
 
 
584 aa  107  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  30.33 
 
 
598 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  32.73 
 
 
451 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 
608 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  29.29 
 
 
414 aa  106  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2329  histidine kinase  28.87 
 
 
470 aa  106  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2275  histidine kinase  28.57 
 
 
394 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0585084  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  28.51 
 
 
371 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0439  histidine kinase  26.95 
 
 
300 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.805878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  27.2 
 
 
613 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  27.63 
 
 
347 aa  105  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
733 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
600 aa  106  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.93 
 
 
493 aa  105  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0674  histidine kinase  30.62 
 
 
332 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174761  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0840  histidine kinase  27.05 
 
 
363 aa  105  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.133727 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
584 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
408 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2057  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
504 aa  104  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.799805  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  28.89 
 
 
555 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0445  histidine kinase  27.71 
 
 
490 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00000298579  normal  0.0488612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.43 
 
 
584 aa  104  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  32.9 
 
 
466 aa  104  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
535 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 
535 aa  104  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 
489 aa  104  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  27.5 
 
 
423 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
585 aa  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0967  histidine kinase  28.96 
 
 
475 aa  103  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
608 aa  103  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 
920 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 
412 aa  103  5e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 
374 aa  103  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  30.34 
 
 
446 aa  103  6e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  31.11 
 
 
497 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  30.47 
 
 
906 aa  103  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  29.88 
 
 
591 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 
591 aa  103  8e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
379 aa  103  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>