More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_7070 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  100 
 
 		 456 aa  931    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4094  histidine kinase  45.74 
 
 		 612 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0202  ATP-binding region ATPase domain protein  44.17 
 
 		 614 aa  250  3e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.331744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5388  histidine kinase  35.37 
 
 		 651 aa  249  1e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 		 528 aa  241  1e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0208  histidine kinase  36.77 
 
 		 532 aa  239  5.999999999999999e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  42.7 
 
 		 511 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3565  histidine kinase  30.73 
 
 		 416 aa  193  4e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567699 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0694  histidine kinase  43.12 
 
 		 479 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5351  histidine kinase  38.75 
 
 		 463 aa  182  8.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0345  histidine kinase  36.79 
 
 		 498 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4969  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 		 422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114897  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2741  histidine kinase  35.06 
 
 		 478 aa  162  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.174621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4520  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.853627  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0512  histidine kinase  35.22 
 
 		 303 aa  158  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03280  two-component system sensor histidine kinase  36.29 
 
 		 467 aa  154  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.827758  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.55 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0952  sensory box histidine kinase  32.64 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000116101  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0256  histidine kinase  27.33 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1074  signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 443 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  30.55 
 
 		 587 aa  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  30.55 
 
 		 587 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  30.46 
 
 		 587 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0770  histidine kinase  31.78 
 
 		 397 aa  140  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.102828  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  30.46 
 
 		 587 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0699  histidine kinase  29.46 
 
 		 412 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 585 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 582 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  33.63 
 
 		 508 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  30.17 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  30.17 
 
 		 587 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  30.17 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  30.17 
 
 		 587 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  33.62 
 
 		 539 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  29.97 
 
 		 587 aa  137  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4090  histidine kinase  32.08 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.789598  hitchhiker  0.00345949 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 		 600 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4603  histidine kinase  31.15 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1849  histidine kinase  33.73 
 
 		 344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0723  histidine kinase  31.49 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1960  sensor histidine kinase  30.83 
 
 		 551 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0440591  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  29.49 
 
 		 257 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 585 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 607 aa  133  6.999999999999999e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03740  PhoR-like protein  30.87 
 
 		 409 aa  132  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.172965  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 412 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 581 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1931  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 591 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 		 489 aa  131  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 592 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3271  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0499416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 815 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 466 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 608 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3027  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 458 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3260  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 458 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3012  sensor histidine kinase  32.03 
 
 		 458 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.171709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2214  sensor histidine kinase KdpD  29.87 
 
 		 910 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.428081  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2948  sensor histidine kinase  32.61 
 
 		 458 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.448702  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0498  histidine kinase  30.3 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2002  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.57 
 
 		 590 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6146  histidine kinase  29.29 
 
 		 465 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 584 aa  127  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3248  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3257  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 1039 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0416  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 377 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.611617 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 594 aa  127  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 444 aa  127  5e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3278  sensor histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 590 aa  126  7e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4160  histidine kinase  27.17 
 
 		 311 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0841988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  32.38 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 584 aa  126  9e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  30.45 
 
 		 584 aa  126  9e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  32.48 
 
 		 347 aa  126  9e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.8 
 
 		 598 aa  125  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0849  histidine kinase  31.91 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1741  histidine kinase  34.5 
 
 		 356 aa  126  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000297787  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 458 aa  125  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2976  histidine kinase  30 
 
 		 458 aa  124  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23989  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.02 
 
 		 537 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.9 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  30 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0887  ATP-binding region, ATPase-like  29.48 
 
 		 451 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3370  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 713 aa  124  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 418 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 421 aa  125  2e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00283134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.47 
 
 		 725 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0656  histidine kinase  29.22 
 
 		 423 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.368822  hitchhiker  0.000112201 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 412 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  29.83 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2092  histidine kinase  30.43 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00961022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  32.62 
 
 		 906 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>