More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3383 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3383  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 617 aa  1239    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.32 
 
 		 652 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1523  sensory box histidine kinase  34.88 
 
 		 787 aa  233  7.000000000000001e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00153524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0286  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.77 
 
 		 424 aa  230  6e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1316  sensory box histidine kinase  34.65 
 
 		 787 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00351204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  34.72 
 
 		 791 aa  221  3.9999999999999997e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  34.17 
 
 		 791 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2076  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 		 387 aa  207  4e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1764  sensor histidine kinase/response regulator  37.85 
 
 		 1093 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.412354  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1493  sensor histidine kinase/response regulator  40.26 
 
 		 1086 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0890895  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1055  sensory box histidine kinase/response regulator  37.78 
 
 		 558 aa  183  7e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.952288  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1243  sensory box histidine kinase  36.86 
 
 		 623 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4149  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 919 aa  177  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1502  Histidine kinase  38.27 
 
 		 919 aa  170  7e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.16 
 
 		 1352 aa  169  9e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0511  histidine kinase  37.02 
 
 		 440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000775208  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  35.27 
 
 		 906 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 885 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 973 aa  163  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 523 aa  162  2e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 		 592 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.67 
 
 		 765 aa  161  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.65 
 
 		 646 aa  160  7e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  39.42 
 
 		 1306 aa  160  7e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 1029 aa  160  8e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.35 
 
 		 785 aa  160  8e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 		 597 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.43 
 
 		 371 aa  159  2e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1953  sensor histidine kinase  34.96 
 
 		 678 aa  159  2e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.105844  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.71 
 
 		 823 aa  158  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3648  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.53 
 
 		 1237 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.289797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 932 aa  156  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.55 
 
 		 1406 aa  156  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35.83 
 
 		 1152 aa  156  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4928  multi-sensor hybrid histidine kinase  31 
 
 		 889 aa  155  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.338102 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 		 456 aa  155  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 1877 aa  155  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 979 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  35.71 
 
 		 861 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2241  sensor histidine kinase  34.66 
 
 		 678 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00553102  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1834  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 		 569 aa  154  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  33.87 
 
 		 1378 aa  153  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4466  histidine kinase  38.52 
 
 		 464 aa  153  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.734574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0116  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 1711 aa  153  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.257821  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05068  composite two-component sensor histidine kinase and response regulator hybrid transcription regulator protein  31.52 
 
 		 676 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  32.89 
 
 		 1287 aa  152  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6046  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 768 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.479069  normal  0.26296 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.33 
 
 		 969 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  36.78 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  36.02 
 
 		 587 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  36.07 
 
 		 1046 aa  151  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 597 aa  152  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  36.02 
 
 		 587 aa  152  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 		 1361 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1418  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 853 aa  151  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  37.99 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1561  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 		 443 aa  150  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.414952 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 		 587 aa  150  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.31 
 
 		 944 aa  150  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5235  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 757 aa  150  6e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1496  histidine kinase  36.25 
 
 		 465 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  35.59 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1631  sensor histidine kinase  32.84 
 
 		 903 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.857286 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  34.2 
 
 		 764 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 585 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  35.59 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  35.59 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  35.59 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 		 977 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  38.3 
 
 		 1233 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  35.59 
 
 		 587 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0286  histidine kinase  38.15 
 
 		 582 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000344798  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 1287 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1128 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.4 
 
 		 1374 aa  148  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  30.66 
 
 		 927 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  40.25 
 
 		 560 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  35.59 
 
 		 587 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  35.38 
 
 		 1236 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  36.65 
 
 		 565 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 		 916 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 678 aa  147  5e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4693  histidine kinase  36.47 
 
 		 561 aa  147  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.3 
 
 		 631 aa  147  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3763  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 		 1255 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  33.74 
 
 		 1378 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1375  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 768 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.397027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6454  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 768 aa  147  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 725 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.32 
 
 		 1363 aa  147  7.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  35.17 
 
 		 587 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0148  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 1048 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.872071 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  30.56 
 
 		 982 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  34.04 
 
 		 762 aa  146  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 		 1582 aa  146  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2084  sensor histidine kinase  32.82 
 
 		 816 aa  146  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 		 1426 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2901  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 		 733 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.248575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2399  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 1131 aa  146  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  35.04 
 
 		 876 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>