More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2006 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  85.05 
 
 		 852 aa  1449    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 852 aa  1746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  62.59 
 
 		 857 aa  1039    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 841 aa  568  1e-160  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.7 
 
 		 704 aa  473  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 		 826 aa  467  9.999999999999999e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 716 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.54 
 
 		 699 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.46 
 
 		 701 aa  445  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 		 697 aa  414  1e-114  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 847 aa  348  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 851 aa  342  2e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.65 
 
 		 857 aa  335  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  27.02 
 
 		 681 aa  263  1e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  28 
 
 		 686 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  25 
 
 		 681 aa  250  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  33.5 
 
 		 822 aa  220  7e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 409 aa  201  3e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  35.26 
 
 		 849 aa  195  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  33.58 
 
 		 846 aa  194  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 1009 aa  172  3e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.5 
 
 		 1331 aa  170  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  27.49 
 
 		 420 aa  167  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  27.25 
 
 		 420 aa  167  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.56 
 
 		 1165 aa  167  9e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  31.6 
 
 		 1177 aa  160  6e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  27.34 
 
 		 1574 aa  159  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  27.57 
 
 		 2035 aa  150  7e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  26.7 
 
 		 420 aa  149  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1193 aa  147  9e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.62 
 
 		 916 aa  145  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.83 
 
 		 1550 aa  145  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.18 
 
 		 1326 aa  145  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  27.79 
 
 		 410 aa  144  7e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  26.46 
 
 		 1683 aa  143  9.999999999999999e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 		 1303 aa  142  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  28.85 
 
 		 923 aa  141  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1622 aa  141  3.9999999999999997e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 1788 aa  141  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 		 1611 aa  141  7e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 1124 aa  140  7.999999999999999e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.24 
 
 		 1499 aa  139  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.3 
 
 		 946 aa  139  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1021 aa  139  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 		 1625 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  30.65 
 
 		 847 aa  137  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.5 
 
 		 1768 aa  137  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 		 1629 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1767 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.67 
 
 		 778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  27.4 
 
 		 861 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.14 
 
 		 1016 aa  136  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  26.9 
 
 		 1763 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.83 
 
 		 1314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 		 1005 aa  135  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 1767 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 		 1629 aa  135  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.53 
 
 		 1033 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 		 1626 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  29.53 
 
 		 979 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 1767 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  28.31 
 
 		 1214 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.82 
 
 		 1240 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3915  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.43 
 
 		 839 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  26.08 
 
 		 1765 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 1362 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  29.65 
 
 		 1001 aa  131  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1118 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.69 
 
 		 1468 aa  131  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  30.59 
 
 		 1346 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 		 1340 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.13 
 
 		 1480 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 		 1284 aa  129  3e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.12 
 
 		 1786 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 1784 aa  127  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 		 1374 aa  127  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.58 
 
 		 1659 aa  127  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1771 aa  127  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2687  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.45 
 
 		 784 aa  126  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.762737  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 		 1632 aa  127  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.14 
 
 		 1782 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2818  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 		 720 aa  126  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.215558  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.86 
 
 		 2213 aa  125  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  28.3 
 
 		 647 aa  125  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.36 
 
 		 912 aa  124  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.21 
 
 		 1765 aa  125  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  27.48 
 
 		 1439 aa  124  6e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.82 
 
 		 1064 aa  124  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.55 
 
 		 1792 aa  124  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  27.87 
 
 		 1417 aa  124  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  30.66 
 
 		 429 aa  124  8e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  30.66 
 
 		 429 aa  124  9e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  29.18 
 
 		 1361 aa  123  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 		 1398 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.19 
 
 		 1275 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.31 
 
 		 1202 aa  123  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 		 434 aa  123  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29 
 
 		 1333 aa  123  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.39 
 
 		 1442 aa  123  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00899  sensory box histidine kinase/response regulator  27.88 
 
 		 1070 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>