More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1269 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
839 aa  1650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4279  major facilitator transporter  61.85 
 
 
426 aa  444  1e-123  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.646646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1510  major facilitator transporter  57.14 
 
 
425 aa  429  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1295  general substrate transporter  58.45 
 
 
423 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.659237  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0663  general substrate transporter  53.81 
 
 
435 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0269429  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  55.22 
 
 
420 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  55.72 
 
 
420 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3269  major facilitator superfamily MFS_1  54.78 
 
 
436 aa  396  1e-109  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.643354  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1063  major facilitator superfamily MFS_1  51.22 
 
 
435 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3101  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.49 
 
 
438 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  53.88 
 
 
420 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3059  metabolite:proton symporter family protein  53.12 
 
 
489 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0806  metabolite:proton symporter family protein  53.12 
 
 
523 aa  392  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.413485  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1576  metabolite:proton symporter family protein  52.62 
 
 
506 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.342246  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3419  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  51.22 
 
 
435 aa  391  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2736  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.49 
 
 
438 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2238  major facilitator transporter  53.35 
 
 
442 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.451405  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2106  metabolite:proton symporter family protein  53.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.22377  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2408  general substrate transporter  52.37 
 
 
436 aa  387  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2638  metabolite:proton symporter family protein  53.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  51.87 
 
 
483 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3026  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  53.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.531832  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2961  major facilitator superfamily permease  53.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1974  metabolite:proton symporter family protein  53.12 
 
 
437 aa  387  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0951  general substrate transporter  51.87 
 
 
436 aa  385  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0991  general substrate transporter  51.87 
 
 
436 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0201608  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  54.15 
 
 
432 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2856  metabolite transport protein  53.47 
 
 
439 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  52.04 
 
 
438 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4094  major facilitator transporter  51.62 
 
 
436 aa  382  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  51.37 
 
 
437 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  51.62 
 
 
437 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4263  general substrate transporter  54.39 
 
 
433 aa  382  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1063  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.66 
 
 
432 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  51.94 
 
 
456 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  53.25 
 
 
437 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1332  major facilitator superfamily MFS_1  51.88 
 
 
433 aa  372  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4161  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  53.41 
 
 
433 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  51.21 
 
 
438 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1813  general substrate transporter  49.65 
 
 
463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0995372  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1832  general substrate transporter  49.65 
 
 
463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.326977  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1879  general substrate transporter  49.65 
 
 
463 aa  355  1e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.96 
 
 
441 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0644  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  49.19 
 
 
442 aa  353  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1369  MFS family transporter  53.26 
 
 
437 aa  351  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2850  General substrate transporter  49.41 
 
 
437 aa  349  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.290987  hitchhiker  0.00573587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2256  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  50.48 
 
 
447 aa  348  2e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.650686  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.52 
 
 
440 aa  347  4e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  52.62 
 
 
433 aa  347  7e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00467  metabolite transport protein  49.76 
 
 
412 aa  347  7e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.53 
 
 
436 aa  346  1e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  45.28 
 
 
425 aa  345  1e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1314  General substrate transporter  45.01 
 
 
470 aa  343  7e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000012233 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4675  major facilitator transporter  45.2 
 
 
628 aa  343  9e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.85896  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  48.57 
 
 
444 aa  337  5.999999999999999e-91  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3830  major facilitator transporter  48.46 
 
 
463 aa  335  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1269  general substrate transporter  44.27 
 
 
470 aa  335  1e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.33062  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0706  major facilitator family transporter  48.56 
 
 
426 aa  332  2e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3923  major facilitator superfamily MFS_1  47.14 
 
 
452 aa  329  1.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0699267  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3159  general substrate transporter  44.71 
 
 
428 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.761686  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30660  sugar phosphate permease  43.89 
 
 
466 aa  327  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3427  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.89 
 
 
441 aa  325  2e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3920  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  48.02 
 
 
440 aa  325  3e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.210524  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2295  major facilitator superfamily MFS_1  45.18 
 
 
452 aa  320  7e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03371  predicted transporter  47.98 
 
 
440 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03324  hypothetical protein  47.98 
 
 
440 aa  318  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4886  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.74 
 
 
440 aa  317  5e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2741  general substrate transporter  46.55 
 
 
431 aa  317  7e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.879641  normal  0.395533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0190  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  47.74 
 
 
440 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3726  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.74 
 
 
440 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3827  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.74 
 
 
440 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3928  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.74 
 
 
440 aa  316  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0194  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  47.74 
 
 
440 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4011  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  47.74 
 
 
440 aa  315  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11030  Sugar (and other) transporter  44.27 
 
 
472 aa  314  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.267916  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05660  metabolite-proton symporter  43.92 
 
 
482 aa  314  4.999999999999999e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2691  general substrate transporter  46.63 
 
 
445 aa  310  1.0000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361229  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  48.27 
 
 
440 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  48.27 
 
 
440 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  48.27 
 
 
440 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  48.27 
 
 
440 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  48.27 
 
 
440 aa  307  4.0000000000000004e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1328  putative permease  39.95 
 
 
436 aa  295  3e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2888  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  43.52 
 
 
434 aa  290  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0536186  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0161  major facilitator transporter  40.19 
 
 
440 aa  290  7e-77  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0662  major facilitator family transporter  44.47 
 
 
393 aa  288  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3744  General substrate transporter  40.94 
 
 
465 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1490  major facilitator superfamily MFS_1  40.8 
 
 
432 aa  280  7e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.81003  normal  0.0711824 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  40.48 
 
 
456 aa  277  5e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  38.46 
 
 
446 aa  273  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1794  major facilitator family transporter  38.8 
 
 
433 aa  270  1e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0265236  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  40.14 
 
 
435 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1626  shikimate transporter  39.68 
 
 
435 aa  266  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0419838  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  39.56 
 
 
425 aa  266  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  40.14 
 
 
435 aa  266  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  39.86 
 
 
434 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3973  shikimate transporter  39.68 
 
 
435 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.483442  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4394  shikimate transporter  39.68 
 
 
435 aa  265  2e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477148  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18260  arabinose efflux permease family protein  40.91 
 
 
438 aa  265  3e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.897354  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4227  shikimate transporter  39.72 
 
 
435 aa  262  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29234  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>