More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3100 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3100  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
476 aa  970    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.718748 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  27.8 
 
 
477 aa  172  1e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3107  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
447 aa  170  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2914  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
533 aa  166  9e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2673  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.99 
 
 
452 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.319226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0784  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.42 
 
 
481 aa  161  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
425 aa  161  3e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
455 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
469 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000408474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0660  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 
461 aa  156  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02380  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.15 
 
 
466 aa  155  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.197859 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0190  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.75 
 
 
487 aa  154  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.482621 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0903  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.79 
 
 
468 aa  153  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.211263  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3441  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 
489 aa  153  8e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.687758  normal  0.0246351 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3240  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
464 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.399255  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3976  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.81 
 
 
464 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
470 aa  151  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0032  histidine kinase  31.37 
 
 
423 aa  150  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1728  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 
499 aa  150  7e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.158171  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3970  two component transcriptional regulator  34.57 
 
 
466 aa  150  7e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.241078  normal  0.103375 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0639  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
465 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  0.883894 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2006  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.25 
 
 
469 aa  147  4.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0452  sensor histidine kinase  30.45 
 
 
469 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2331  sensor histidine kinase  29.94 
 
 
466 aa  145  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1335  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
480 aa  145  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.179975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0945  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
466 aa  144  3e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.564865  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0944  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 
477 aa  143  5e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.283053  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3518  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.72 
 
 
462 aa  143  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00833469  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1373  histidine kinase  32.99 
 
 
478 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.563481  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2013  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.11 
 
 
490 aa  143  7e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327957  normal  0.42057 
 
 
-
 
NC_004310  BR0613  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.639539  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0612  sensor histidine kinase  26.71 
 
 
467 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0274  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 
469 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0926  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 
469 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.147036  decreased coverage  0.00245502 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1075  histidine kinase  31.29 
 
 
469 aa  140  7e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.926478  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1447  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
486 aa  138  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 
486 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.764818 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2237  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
477 aa  136  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.128142  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0002  ATP-binding region ATPase domain protein  27.63 
 
 
592 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
465 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3483  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
502 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0636305  normal  0.224106 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0312  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
469 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.029986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
352 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.2174  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1417  ATPase domain-containing protein  29.38 
 
 
470 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.110308 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5480  histidine kinase  32.88 
 
 
481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1477  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
459 aa  135  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000762888  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1209  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
475 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  24.46 
 
 
461 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1987  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 
489 aa  134  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.426043  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1198  Signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 
486 aa  134  3e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.407159  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 
640 aa  134  3e-30  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
463 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4300  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
459 aa  134  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.263692  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1232  sensor histidine kinase  26.79 
 
 
448 aa  133  9e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.258987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2473  heavy metal sensor kinase  31.51 
 
 
455 aa  133  9e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  29.67 
 
 
486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2314  histidine kinase  32.97 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.697892  normal  0.500466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1130  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
469 aa  132  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4466  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
480 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.785894  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1011  sensor histidine kinase  27.21 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0751  hypothetical protein  26.8 
 
 
357 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1366  histidine kinase  28 
 
 
463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0287357  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.54 
 
 
447 aa  131  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0780  hypothetical protein  26.89 
 
 
357 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5332  histidine kinase sensor  29.43 
 
 
471 aa  131  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0668535  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0405  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
476 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152478  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.52 
 
 
492 aa  131  3e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  31.44 
 
 
359 aa  131  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4694  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.74 
 
 
513 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1383  histidine kinase  29.33 
 
 
471 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.141813  normal  0.0864721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  33.98 
 
 
857 aa  130  5.0000000000000004e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3446  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.66 
 
 
488 aa  130  5.0000000000000004e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.406283  normal  0.729768 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1525  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.85 
 
 
472 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0375  histidine kinase  31.8 
 
 
476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3422  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
464 aa  130  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.12932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2713  putative two-component sensor  31.1 
 
 
471 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0538735  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15520  heavy metal sensor histidine protein kinase, two-component  29.27 
 
 
431 aa  130  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2665  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.47 
 
 
467 aa  129  8.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11798  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4517  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
448 aa  129  8.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.233298  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.19 
 
 
459 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1371  two component sensor kinase  31.09 
 
 
468 aa  129  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4370  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0947817 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 
515 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.880509  hitchhiker  0.00000493136 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0375  sensor protein irlS  28.71 
 
 
483 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.216431  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
396 aa  128  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27800  putative two-component sensor  29.49 
 
 
443 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.350506 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.87 
 
 
473 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4284  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 
460 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.677034  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2934  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 
458 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0322426  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2347  putative two-component sensor  29.49 
 
 
443 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
419 aa  127  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00301262  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5712  histidine kinase  29.12 
 
 
483 aa  127  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.478101  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0328  ATPase domain-containing protein  31.12 
 
 
476 aa  127  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3856  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  26.76 
 
 
446 aa  126  7e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228266  normal  0.918767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0292  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
453 aa  126  8.000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.671224  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3085  putative two-component sensor histidine kinase  32.75 
 
 
486 aa  126  9e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1437  heavy metal sensor histidine kinase  29.09 
 
 
460 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0309  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 
474 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>