More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1957 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.95 
 
 		 857 aa  743    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  52.68 
 
 		 847 aa  932    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 851 aa  1757    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  34 
 
 		 686 aa  417  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  32.29 
 
 		 681 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 857 aa  369  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  31.12 
 
 		 681 aa  361  3e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 		 704 aa  347  4e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.02 
 
 		 841 aa  342  2e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.27 
 
 		 852 aa  342  2e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 		 826 aa  335  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 852 aa  312  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 		 699 aa  309  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.84 
 
 		 701 aa  305  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 716 aa  304  5.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 697 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  27.02 
 
 		 1331 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 409 aa  198  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1118 aa  197  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  29.87 
 
 		 822 aa  193  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.79 
 
 		 1165 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.76 
 
 		 1326 aa  184  4.0000000000000006e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2858  signal transduction histidine kinase-like protein  26.86 
 
 		 1001 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.920291  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  31.63 
 
 		 429 aa  184  7e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  26.24 
 
 		 1574 aa  183  9.000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  31.63 
 
 		 429 aa  183  1e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 		 1033 aa  180  1e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.65 
 
 		 1340 aa  179  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 		 1009 aa  179  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.72 
 
 		 876 aa  176  9.999999999999999e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.46 
 
 		 921 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.26 
 
 		 1771 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 1767 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.05 
 
 		 1442 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.12 
 
 		 1499 aa  174  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  26.09 
 
 		 2035 aa  173  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 		 1767 aa  173  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.58 
 
 		 1548 aa  173  1e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  25.19 
 
 		 1763 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  26.78 
 
 		 1287 aa  171  4e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.67 
 
 		 1767 aa  171  6e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  26.02 
 
 		 1177 aa  170  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.2 
 
 		 1193 aa  170  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 929 aa  169  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  25.68 
 
 		 1683 aa  169  2.9999999999999998e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  28.32 
 
 		 420 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 		 946 aa  167  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.61 
 
 		 1784 aa  167  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  28.1 
 
 		 420 aa  167  9e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  26.79 
 
 		 923 aa  167  9e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.81 
 
 		 1782 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.7 
 
 		 1166 aa  166  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.85 
 
 		 1255 aa  166  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  24.14 
 
 		 1765 aa  165  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.12 
 
 		 1303 aa  164  6e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  25.56 
 
 		 1135 aa  164  6e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.05 
 
 		 1792 aa  164  7e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.06 
 
 		 410 aa  164  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0870  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.54 
 
 		 1786 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.31 
 
 		 1550 aa  163  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.09 
 
 		 2213 aa  163  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1021 aa  163  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.31 
 
 		 833 aa  162  3e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 		 1611 aa  161  5e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.38 
 
 		 1582 aa  160  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 981 aa  160  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.79 
 
 		 916 aa  159  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.42 
 
 		 1625 aa  159  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  25.43 
 
 		 852 aa  158  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.66 
 
 		 1765 aa  158  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  25.8 
 
 		 940 aa  158  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.41 
 
 		 1064 aa  158  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.59 
 
 		 1267 aa  158  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  26.05 
 
 		 1014 aa  157  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 		 1310 aa  157  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.01 
 
 		 1202 aa  157  6e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.4 
 
 		 801 aa  157  9e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1245 aa  157  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.47 
 
 		 1005 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.1 
 
 		 1480 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.68 
 
 		 977 aa  155  2.9999999999999998e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.83 
 
 		 1240 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.77 
 
 		 816 aa  155  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  23.43 
 
 		 1417 aa  154  7e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  27.76 
 
 		 861 aa  154  8e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.11 
 
 		 1560 aa  153  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3120  putative periplasmic ligand-binding sensor protein  26.33 
 
 		 1653 aa  154  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0419  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.83 
 
 		 1260 aa  153  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.784662  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.3 
 
 		 1629 aa  153  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.37 
 
 		 1632 aa  153  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.91 
 
 		 1426 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  25.28 
 
 		 647 aa  152  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 		 1629 aa  151  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  29.78 
 
 		 1200 aa  151  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  25.44 
 
 		 1364 aa  151  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 		 912 aa  151  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.38 
 
 		 1603 aa  151  6e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.05 
 
 		 1016 aa  151  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 		 1788 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.01 
 
 		 1128 aa  150  8e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>