More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2193 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  59.86 
 
 		 701 aa  843    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.55 
 
 		 699 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 		 716 aa  1478    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  50.5 
 
 		 704 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  45.17 
 
 		 697 aa  605  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 826 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 		 852 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.99 
 
 		 841 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.39 
 
 		 857 aa  457  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 		 852 aa  434  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.48 
 
 		 847 aa  371  1e-101  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 857 aa  337  2.9999999999999997e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.66 
 
 		 851 aa  326  1e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  38 
 
 		 822 aa  272  1e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  28.45 
 
 		 686 aa  262  2e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  26.97 
 
 		 681 aa  233  6e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  26.18 
 
 		 681 aa  228  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  38.57 
 
 		 846 aa  222  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  38.02 
 
 		 849 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 409 aa  181  4e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2263  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1009 aa  173  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  29.87 
 
 		 420 aa  167  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 1014 aa  167  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  29.87 
 
 		 420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 		 1193 aa  165  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.84 
 
 		 1240 aa  164  7e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  29.45 
 
 		 1214 aa  159  1e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.36 
 
 		 1499 aa  159  1e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  26.71 
 
 		 861 aa  159  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 		 1124 aa  159  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0544  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.43 
 
 		 981 aa  157  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.811836  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  30.36 
 
 		 1177 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.89 
 
 		 1398 aa  155  2.9999999999999998e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  29.85 
 
 		 1331 aa  152  2e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.55 
 
 		 1397 aa  152  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0100  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1182 aa  151  5e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.63 
 
 		 778 aa  150  8e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  27.22 
 
 		 955 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  29.19 
 
 		 429 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.24 
 
 		 1326 aa  148  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 1166 aa  148  3e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  28.96 
 
 		 429 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1659 aa  147  5e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.56 
 
 		 946 aa  147  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.8 
 
 		 1442 aa  147  6e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1508  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.11 
 
 		 1303 aa  147  8.000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30 
 
 		 1021 aa  147  9e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.24 
 
 		 1550 aa  146  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1381  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.14 
 
 		 1468 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.770562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.98 
 
 		 1611 aa  146  1e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.03 
 
 		 1040 aa  145  3e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  26.96 
 
 		 847 aa  144  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.32 
 
 		 1064 aa  144  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.98 
 
 		 1363 aa  144  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  29.33 
 
 		 1574 aa  144  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 		 1033 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.59 
 
 		 1109 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.876623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 		 1788 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.9 
 
 		 1480 aa  142  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1876  histidine kinase  23.71 
 
 		 979 aa  142  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0246829  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 		 936 aa  141  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  27.6 
 
 		 1135 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 		 1165 aa  140  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.92 
 
 		 835 aa  140  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.59 
 
 		 916 aa  140  7e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2979  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.87 
 
 		 1340 aa  140  7.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.698765 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.84 
 
 		 921 aa  140  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  27.16 
 
 		 1626 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  26.64 
 
 		 2213 aa  140  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.06 
 
 		 1333 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.73 
 
 		 876 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  27.16 
 
 		 852 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  28.81 
 
 		 2035 aa  139  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.34 
 
 		 1203 aa  139  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.48 
 
 		 1309 aa  138  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1943  histidine kinase  28.4 
 
 		 647 aa  138  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.539019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  27.17 
 
 		 1179 aa  137  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.54 
 
 		 920 aa  137  5e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1629 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.19 
 
 		 1629 aa  137  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3714  PAS  31.17 
 
 		 1028 aa  137  9e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.101634 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  29.34 
 
 		 1763 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.05 
 
 		 1090 aa  136  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5576  sensor/response regulator hybrid  23.9 
 
 		 962 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.84 
 
 		 957 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.5 
 
 		 1284 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.14 
 
 		 1625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.04 
 
 		 1765 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.19 
 
 		 1202 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  28.64 
 
 		 977 aa  135  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0500  histidine kinase  26.22 
 
 		 940 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 1199 aa  134  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  26.88 
 
 		 1683 aa  134  6.999999999999999e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.58 
 
 		 1275 aa  134  7.999999999999999e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  27.31 
 
 		 1030 aa  133  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 1622 aa  133  9e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  23.7 
 
 		 923 aa  133  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 		 925 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4759  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.62 
 
 		 593 aa  133  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0993289 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>