More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2790 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  875    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  99.77 
 
 
429 aa  872    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.56 
 
 
409 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.86 
 
 
851 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  32.11 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  31.65 
 
 
420 aa  219  7.999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
847 aa  212  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  30.71 
 
 
681 aa  199  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  29.29 
 
 
686 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  28.84 
 
 
681 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
699 aa  188  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 
841 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.14 
 
 
857 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.34 
 
 
826 aa  183  6e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
857 aa  178  2e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.15 
 
 
704 aa  176  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
697 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.89 
 
 
716 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  38.17 
 
 
461 aa  171  3e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.37 
 
 
852 aa  168  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  38.08 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
461 aa  166  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.63 
 
 
701 aa  159  7e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  30.64 
 
 
420 aa  157  3e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  35.59 
 
 
496 aa  157  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.38 
 
 
410 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.88 
 
 
852 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.6 
 
 
480 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
485 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 
480 aa  108  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.92 
 
 
434 aa  103  4e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  33.06 
 
 
822 aa  101  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.53 
 
 
425 aa  100  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  28.69 
 
 
846 aa  97.8  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  27.84 
 
 
849 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  25.1 
 
 
734 aa  89  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  26.29 
 
 
412 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 
412 aa  86.7  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
408 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  26.4 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  26.4 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  26.4 
 
 
465 aa  83.2  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.72 
 
 
747 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.72 
 
 
747 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.72 
 
 
747 aa  82.8  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  26 
 
 
465 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
412 aa  81.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1274  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.38 
 
 
416 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.465456  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5692  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
733 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.358627 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  25.6 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0975  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.78 
 
 
683 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
422 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
412 aa  77.8  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 
498 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.38 
 
 
367 aa  77.4  0.0000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0051  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 
651 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  26.1 
 
 
486 aa  77  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.19 
 
 
752 aa  76.6  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  26.71 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.26 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2251  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  25.29 
 
 
657 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  25.59 
 
 
567 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
702 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  24.19 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  24.64 
 
 
770 aa  76.3  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 
713 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  26.71 
 
 
458 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  24.03 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
566 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  24.92 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  28.17 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.41 
 
 
607 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  24.76 
 
 
450 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  28.4 
 
 
522 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.23 
 
 
917 aa  75.1  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26 
 
 
674 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 
438 aa  74.7  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.69 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  26.87 
 
 
308 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2961  heavy metal sensor Signal transduction histidine Kinases (STHK)  28.27 
 
 
468 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  26.38 
 
 
458 aa  74.7  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1509  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 
565 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  23.87 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.38 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.38 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.38 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2316  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
471 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.79 
 
 
547 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.38 
 
 
608 aa  73.9  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1684  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.93 
 
 
581 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0799101  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.38 
 
 
608 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  23.55 
 
 
458 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  23.64 
 
 
367 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1199  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 
604 aa  73.2  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00529725 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 
564 aa  73.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
600 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  26.56 
 
 
498 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
594 aa  73.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.756975 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>