More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4046 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
434 aa  878    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  66.18 
 
 
425 aa  533  1e-150  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  53.24 
 
 
420 aa  423  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 
409 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  27.52 
 
 
852 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  28.9 
 
 
410 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.44 
 
 
847 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  24.46 
 
 
681 aa  111  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 
841 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  25.12 
 
 
686 aa  106  6e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.17 
 
 
851 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  32.35 
 
 
461 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
461 aa  103  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  24.76 
 
 
681 aa  102  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.17 
 
 
852 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 
565 aa  101  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.51 
 
 
857 aa  100  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.1 
 
 
857 aa  98.2  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  26.88 
 
 
420 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  31.95 
 
 
496 aa  97.1  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  26.59 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0792  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.93 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.389456  hitchhiker  0.00398352 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
480 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  32.76 
 
 
535 aa  90.1  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.78 
 
 
480 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  31.67 
 
 
461 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1931  ATPase domain-containing protein  30.17 
 
 
423 aa  87.8  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.508093  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
654 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.78 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
919 aa  86.3  9e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
579 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1396  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.29 
 
 
547 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.45 
 
 
356 aa  84  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2007  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000116465  normal  0.0324755 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2122  sensor histidine kinase  29.69 
 
 
447 aa  82.4  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2813  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
377 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.963287  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  29.82 
 
 
849 aa  82.8  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3069  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0646  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.71 
 
 
484 aa  82.8  0.00000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.609641  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2950  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 
378 aa  82.8  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.37884  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1269  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 
839 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.834147 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1665  putative sensor/response regulator hybrid  31 
 
 
918 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.879832  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.73 
 
 
542 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2367  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.74 
 
 
759 aa  82  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0367547  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2746  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.94 
 
 
596 aa  82  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.313231  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 
570 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
718 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  33.77 
 
 
1347 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.99 
 
 
826 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
356 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 
614 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.39 
 
 
990 aa  80.9  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 
699 aa  80.9  0.00000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 
485 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
848 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_84  histidine kinase  28.69 
 
 
1084 aa  80.1  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  30.04 
 
 
846 aa  80.5  0.00000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  43.24 
 
 
542 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  33.79 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09493  two-component system sensor histidine kinase  23.34 
 
 
511 aa  80.1  0.00000000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.905001  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  34.47 
 
 
550 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  29.49 
 
 
830 aa  80.1  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 
630 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  26.46 
 
 
822 aa  80.1  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.35 
 
 
704 aa  79.7  0.00000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  22.71 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  22.71 
 
 
429 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
785 aa  79.3  0.0000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
528 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  36.52 
 
 
394 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4382  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 
644 aa  79  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.345049  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  30.04 
 
 
1379 aa  79  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.57 
 
 
602 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0119  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
571 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.412791  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4693  histidine kinase  30.9 
 
 
1120 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.027571  hitchhiker  0.0000750184 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  27.16 
 
 
1230 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.9 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
699 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
722 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 
408 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.74 
 
 
382 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 
386 aa  77  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
923 aa  77  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  34.78 
 
 
395 aa  77  0.0000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  26.3 
 
 
914 aa  76.6  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3321  histidine kinase  28.2 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000784482 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 
394 aa  76.6  0.0000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0066  histidine kinase  34.06 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.126071  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0283  sensor histidine kinase  40.54 
 
 
600 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0310961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  28.22 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  39.82 
 
 
592 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2516  histidine kinase  27.8 
 
 
495 aa  75.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142039  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 
850 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  29.07 
 
 
581 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
362 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4211  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
403 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.108613  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  26.98 
 
 
774 aa  76.3  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.398115 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>