More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3506 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  100 
 
 		 496 aa  1012    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.66 
 
 		 480 aa  570  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.81 
 
 		 480 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.97 
 
 		 485 aa  543  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.58 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  55.58 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  57.08 
 
 		 461 aa  499  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  35.5 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  35.5 
 
 		 429 aa  152  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 409 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 		 704 aa  134  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 847 aa  128  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 		 851 aa  125  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.19 
 
 		 826 aa  124  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  31.6 
 
 		 681 aa  123  8e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  33.06 
 
 		 681 aa  122  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  28.75 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  28.33 
 
 		 420 aa  121  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  29.08 
 
 		 686 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 699 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 		 857 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 857 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.47 
 
 		 697 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  29.22 
 
 		 822 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 		 716 aa  109  1e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 		 852 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.78 
 
 		 841 aa  108  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.68 
 
 		 678 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.47 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  30.99 
 
 		 846 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  32.94 
 
 		 849 aa  106  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 		 701 aa  103  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 408 aa  103  7e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  29.31 
 
 		 770 aa  101  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.13 
 
 		 619 aa  100  4e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  28.12 
 
 		 439 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 402 aa  101  4e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 412 aa  100  8e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.92 
 
 		 602 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 678 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 		 570 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  33.07 
 
 		 412 aa  98.2  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  30.04 
 
 		 621 aa  98.2  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  32.64 
 
 		 608 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  32.64 
 
 		 608 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  32.64 
 
 		 608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.64 
 
 		 608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  32.64 
 
 		 608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  32.64 
 
 		 608 aa  97.4  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  29.53 
 
 		 482 aa  97.4  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.95 
 
 		 434 aa  97.4  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  27.95 
 
 		 458 aa  97.1  7e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 565 aa  97.1  7e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  32.16 
 
 		 358 aa  96.7  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  27.95 
 
 		 458 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 919 aa  96.3  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  26.47 
 
 		 470 aa  96.3  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  27.91 
 
 		 458 aa  95.9  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  27.95 
 
 		 458 aa  95.5  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  28.57 
 
 		 429 aa  95.5  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2824  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 645 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 702 aa  95.5  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 		 679 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.53 
 
 		 852 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  32.39 
 
 		 626 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  28.82 
 
 		 458 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.14 
 
 		 566 aa  95.1  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 785 aa  94.7  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 683 aa  94.7  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  27.95 
 
 		 458 aa  94.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2370  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 672 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 571 aa  94.4  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  27.76 
 
 		 420 aa  94  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 641 aa  94  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  32.05 
 
 		 248 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 850 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 495 aa  93.2  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.82 
 
 		 801 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 459 aa  92  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  27.67 
 
 		 458 aa  92  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4825  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 582 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.924426 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 497 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  30.04 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  27.53 
 
 		 410 aa  92  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 594 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  33.61 
 
 		 600 aa  92.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  37.29 
 
 		 566 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  30.71 
 
 		 465 aa  91.7  3e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  27.61 
 
 		 458 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 774 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  26.42 
 
 		 785 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  30.25 
 
 		 587 aa  91.7  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  29.88 
 
 		 1710 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 577 aa  91.7  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 		 571 aa  91.3  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  27.24 
 
 		 459 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>