More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4505 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 480 aa  980    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  59.66 
 
 		 496 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.11 
 
 		 480 aa  537  1e-151  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.88 
 
 		 485 aa  534  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 		 461 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  46.72 
 
 		 461 aa  405  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  48.46 
 
 		 461 aa  392  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.14 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 704 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 826 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 		 699 aa  115  3e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 		 851 aa  114  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.95 
 
 		 847 aa  114  6e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  30.38 
 
 		 681 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 681 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  29.83 
 
 		 686 aa  109  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 852 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  28.27 
 
 		 822 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  26.23 
 
 		 420 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  28.57 
 
 		 429 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  25.82 
 
 		 420 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  28.57 
 
 		 429 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 		 697 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 852 aa  101  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  29.58 
 
 		 410 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.09 
 
 		 841 aa  99.8  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.74 
 
 		 857 aa  99.4  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 857 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  27.07 
 
 		 770 aa  97.4  6e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 		 425 aa  95.9  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  31.25 
 
 		 846 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  27.07 
 
 		 420 aa  94.4  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 683 aa  92.8  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.67 
 
 		 716 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 		 607 aa  91.7  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.29 
 
 		 701 aa  90.9  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1767  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 		 785 aa  88.6  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0937227 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  32.81 
 
 		 581 aa  88.2  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 439 aa  87.8  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  31.16 
 
 		 774 aa  87.4  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0719  Signal transduction histidine kinase sensor  25.45 
 
 		 785 aa  87.4  5e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00268576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 557 aa  87.4  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 581 aa  87  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 566 aa  87  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  29.74 
 
 		 849 aa  87  7e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  28.63 
 
 		 248 aa  86.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2633  histidine kinase  30.12 
 
 		 566 aa  86.7  8e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 498 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2043  histidine kinase  32.34 
 
 		 560 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 581 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3444  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.61 
 
 		 511 aa  85.9  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0299421  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  25.67 
 
 		 589 aa  85.1  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 575 aa  85.1  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  41.82 
 
 		 594 aa  84.7  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.4 
 
 		 602 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.08 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.8 
 
 		 498 aa  84  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0892  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  41.07 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  29.05 
 
 		 248 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 453 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  32.51 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.75 
 
 		 497 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  26.59 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1790  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 453 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000385463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  32.51 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2886  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 		 640 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.929142 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2828  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1833  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286325  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1807  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000147416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 919 aa  81.3  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  32.1 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1976  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 453 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00238966  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  32.1 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2011  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 459 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.62576e-42 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  32.1 
 
 		 465 aa  81.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  42.16 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0311  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.92 
 
 		 383 aa  81.3  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 595 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 823 aa  81.3  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  31.85 
 
 		 469 aa  80.5  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 683 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1191  histidine kinase  37.5 
 
 		 472 aa  80.9  0.00000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000100343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  30.69 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 		 516 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.59 
 
 		 678 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 392 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  46 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  28.69 
 
 		 498 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 		 682 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  43.69 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1978  sensor histidine kinase  28.03 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0153345  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0189  histidine kinase  30.82 
 
 		 598 aa  80.1  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.602586 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  27.08 
 
 		 724 aa  80.1  0.00000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>