More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3444 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3444  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
511 aa  1033    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0299421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  42.02 
 
 
819 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.78 
 
 
819 aa  182  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.5 
 
 
804 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.54 
 
 
630 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
584 aa  173  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  36.14 
 
 
560 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 
592 aa  171  4e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  36.08 
 
 
592 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
654 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  35.11 
 
 
584 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
919 aa  166  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 
542 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.45 
 
 
586 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  33.03 
 
 
548 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
548 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.42 
 
 
548 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  33.54 
 
 
516 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
611 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 
611 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0790  histidine kinase  36.78 
 
 
522 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  34.46 
 
 
611 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
589 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  35.11 
 
 
542 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.68 
 
 
801 aa  158  2e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 
594 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
602 aa  158  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0888  histidine kinase  31.45 
 
 
647 aa  157  4e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0671  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
987 aa  157  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.239322  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0701  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
545 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310619 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
515 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
662 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 
970 aa  155  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
392 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2233  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.57 
 
 
747 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
557 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  31.81 
 
 
674 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 
575 aa  154  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
402 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 
990 aa  154  5e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
588 aa  153  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  31.27 
 
 
486 aa  152  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.14 
 
 
1808 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  38.33 
 
 
541 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.52 
 
 
916 aa  152  1e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 
408 aa  151  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
683 aa  151  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 
522 aa  150  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  35.02 
 
 
1062 aa  150  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.02 
 
 
844 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2111  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
682 aa  150  5e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1243  histidine kinase  34.7 
 
 
654 aa  150  6e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0706231 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  35.59 
 
 
1061 aa  150  8e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1276  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.24 
 
 
642 aa  149  8e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1250  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  38.14 
 
 
506 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.112207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1234 aa  148  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0616  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  36.43 
 
 
908 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0119428 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.57 
 
 
572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.363862  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  33.33 
 
 
552 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.22 
 
 
656 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1502  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  37.96 
 
 
952 aa  148  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  33.22 
 
 
656 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.51 
 
 
1168 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  36.02 
 
 
408 aa  147  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  36.02 
 
 
408 aa  147  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1167  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
551 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  35.56 
 
 
1187 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3408  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.29 
 
 
571 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1746  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  38.82 
 
 
506 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3565  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.33 
 
 
641 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.69 
 
 
1247 aa  145  1e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
567 aa  145  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
480 aa  146  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 
486 aa  146  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1382  histidine kinase  37.3 
 
 
912 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  31.27 
 
 
673 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3488  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.71 
 
 
508 aa  145  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4395  sensory box histidine kinase  34.04 
 
 
678 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.54023  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  35.26 
 
 
626 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3535  histidine kinase  34.84 
 
 
410 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2947  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.93 
 
 
642 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  34.82 
 
 
863 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4423  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
678 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.69 
 
 
470 aa  144  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
842 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
676 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0906179 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  32.64 
 
 
567 aa  144  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  37.34 
 
 
614 aa  144  5e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2960  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 
557 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  32.99 
 
 
1901 aa  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2603  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
570 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  33.6 
 
 
587 aa  143  7e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0936  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
803 aa  143  8e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0173561 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  34 
 
 
395 aa  143  8e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
676 aa  143  9e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
491 aa  143  9e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4089  PAS  32.98 
 
 
678 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.465781  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3157  histidine kinase  32.68 
 
 
484 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2646  sensor histidine kinase  35.25 
 
 
445 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215713  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>