More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4042 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  71.74 
 
 		 461 aa  662    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  939    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  100 
 
 		 461 aa  939    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  55.58 
 
 		 496 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  50.98 
 
 		 480 aa  457  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  47.38 
 
 		 480 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.57 
 
 		 485 aa  419  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  37.93 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  37.93 
 
 		 429 aa  160  6e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 681 aa  137  5e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  37.3 
 
 		 410 aa  137  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.83 
 
 		 704 aa  134  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  32.77 
 
 		 681 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  30.42 
 
 		 420 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  30 
 
 		 420 aa  128  2.0000000000000002e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  33.2 
 
 		 686 aa  126  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 697 aa  118  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  29.11 
 
 		 847 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.97 
 
 		 826 aa  118  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 699 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.44 
 
 		 851 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 		 841 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003077  autoinducer 1 sensor kinase/phosphatase luxN  30.29 
 
 		 846 aa  110  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.45 
 
 		 852 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02766  histidine kinase  30.58 
 
 		 849 aa  108  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  29.22 
 
 		 822 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 		 857 aa  104  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 434 aa  103  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 		 716 aa  103  7e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  32.2 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  30 
 
 		 248 aa  100  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 683 aa  99.8  9e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 570 aa  96.7  9e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0924  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 		 701 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.17 
 
 		 857 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 		 852 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 683 aa  95.9  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 850 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.43 
 
 		 850 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.17 
 
 		 1465 aa  94.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 566 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  31.12 
 
 		 465 aa  93.6  7e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  31.12 
 
 		 465 aa  93.6  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  31.12 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  30.42 
 
 		 552 aa  92.8  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  28.87 
 
 		 248 aa  92  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 571 aa  92  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  30.71 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  31.12 
 
 		 465 aa  92  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  27.38 
 
 		 439 aa  90.5  6e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0750  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1771  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.89 
 
 		 923 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.357218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 671 aa  89.7  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  28.29 
 
 		 770 aa  89.7  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 		 678 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.54 
 
 		 614 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 713 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 		 990 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.81 
 
 		 1146 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2683  ATP-binding region ATPase domain protein  27.66 
 
 		 746 aa  88.2  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.301078 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0172  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 565 aa  87.4  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.5 
 
 		 544 aa  87.4  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1728  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 462 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.091875  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  29.63 
 
 		 1255 aa  87.4  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 		 392 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.04 
 
 		 848 aa  87  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  27.92 
 
 		 577 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 412 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 422 aa  86.7  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 577 aa  86.7  8e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 		 382 aa  86.7  9e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 955 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 714 aa  85.9  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  30.08 
 
 		 734 aa  86.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1349  histidine kinase  26.47 
 
 		 554 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.134136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0690  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40.95 
 
 		 1186 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 		 425 aa  85.9  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2710  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.74 
 
 		 756 aa  86.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.438958  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 1021 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  36.94 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  26.72 
 
 		 567 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  30.25 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2725  histidine kinase  42.34 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.102718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  36.08 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 402 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7222  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  42.72 
 
 		 589 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.368099  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  39.81 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.14 
 
 		 686 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  42.72 
 
 		 611 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  26.78 
 
 		 1062 aa  84.3  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1222  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 686 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0583301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4409  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 		 585 aa  84.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0711  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 702 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0673  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  28.1 
 
 		 1215 aa  84.3  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.37 
 
 		 491 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.303105  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  41.07 
 
 		 627 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3029  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.28 
 
 		 652 aa  84  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>