More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5020 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5020  histidine kinase  100 
 
 		 420 aa  862    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.871179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3513  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  54.63 
 
 		 425 aa  410  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.600596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  53.24 
 
 		 434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.421947 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2923  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.63 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.950573 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0018  seriplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 409 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.702355 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2006  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 		 852 aa  149  8e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000507491  normal  0.0782006 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0165  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.64 
 
 		 826 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0455  sensor histidine kinase/response regulator LuxN  25.41 
 
 		 686 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5059  Hpt sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 		 841 aa  130  6e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1957  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.75 
 
 		 851 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4754  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.93 
 
 		 852 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.16465  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  26.54 
 
 		 681 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2659  hypothetical protein  30.64 
 
 		 429 aa  124  4e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2790  hypothetical protein  30.64 
 
 		 429 aa  123  7e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0671  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.66 
 
 		 857 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269812 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0927  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.52 
 
 		 704 aa  122  9e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0769186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6245  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 		 857 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  25.06 
 
 		 681 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0484  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.89 
 
 		 847 aa  119  7.999999999999999e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1801  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  26.13 
 
 		 699 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000631548  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0885  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 		 697 aa  107  4e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2574  hypothetical protein  25.37 
 
 		 420 aa  105  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2428  hypothetical protein  25.37 
 
 		 420 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3929  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.72259  normal  0.649992 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4042  histidine kinase  32.2 
 
 		 461 aa  102  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.601424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 406 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 		 458 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0696  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 570 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7077  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 480 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.871735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  31.92 
 
 		 899 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4413  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.97 
 
 		 565 aa  95.1  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 		 480 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3506  ATP-binding region, ATPase-like  27.76 
 
 		 496 aa  94  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0457672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.68 
 
 		 422 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  30.43 
 
 		 535 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2161  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2193  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 		 716 aa  90.9  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.14825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1157  autoinducer regulatory protein AinR  28.38 
 
 		 822 aa  90.1  7e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  29.39 
 
 		 1255 aa  89.7  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_003296  RS05203  two-component transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  32.64 
 
 		 461 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0394987  normal  0.0112976 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  30.77 
 
 		 907 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1970  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 		 602 aa  88.6  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.316288  normal  0.365319 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2061  histidine kinase  28.52 
 
 		 412 aa  88.2  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000174417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.96 
 
 		 1029 aa  86.7  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  29.78 
 
 		 502 aa  86.7  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 639 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4068  histidine kinase  30.99 
 
 		 594 aa  86.3  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.379101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3461  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.39 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0023015  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.45 
 
 		 485 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 628 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1489  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0687129  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3078  histidine kinase  30.62 
 
 		 774 aa  84.7  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.398115 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 699 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  26.95 
 
 		 729 aa  84  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7070  histidine kinase  26.72 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.05 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  31.11 
 
 		 458 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  31.11 
 
 		 458 aa  83.2  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.15 
 
 		 619 aa  83.2  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0522  two component sensor kinase/response regulator hybrid  28.28 
 
 		 751 aa  83.2  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  30.29 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.82 
 
 		 382 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 		 378 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.9 
 
 		 1252 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1674  histidine kinase  28.69 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 463 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.64 
 
 		 431 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  28.33 
 
 		 461 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2577  sensor histidine kinase  29.5 
 
 		 349 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0417  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 495 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648211  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  30.54 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  25.14 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  30.54 
 
 		 465 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  30.54 
 
 		 465 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  28.21 
 
 		 462 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  29.46 
 
 		 587 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1989  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 566 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2708  histidine kinase  31.56 
 
 		 469 aa  80.1  0.00000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.128907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  30.67 
 
 		 458 aa  80.5  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.04 
 
 		 1808 aa  80.1  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0072  histidine kinase  30.2 
 
 		 810 aa  80.5  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  29.69 
 
 		 589 aa  80.1  0.00000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  29.48 
 
 		 1347 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  27.27 
 
 		 567 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  30.13 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 614 aa  80.1  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2807  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 		 505 aa  80.1  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  38.39 
 
 		 456 aa  79.7  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  30.22 
 
 		 465 aa  79.7  0.00000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4197  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 679 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4320  histidine kinase  31.28 
 
 		 359 aa  79.7  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3388  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 648 aa  79  0.0000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 583 aa  79.3  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>