More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3793 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  268  2.9999999999999997e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 207 aa  89.4  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 212 aa  88.6  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 203 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 214 aa  88.2  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  38.05 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.94 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  35.43 
 
 		 204 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 218 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 210 aa  80.5  0.000000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  38.33 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  36.8 
 
 		 198 aa  79.3  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 122 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 140 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  34.92 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  34.59 
 
 		 206 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  35.16 
 
 		 136 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  36.36 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1192  transcriptional regulator of LuxR family protein  35.83 
 
 		 214 aa  76.6  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.4 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  36.8 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  32.14 
 
 		 226 aa  74.3  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 210 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 216 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 216 aa  73.9  0.0000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.61 
 
 		 213 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 117 aa  73.9  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2247  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 119 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.135382  normal  0.142459 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  37.27 
 
 		 705 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3868  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  34.38 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  33.94 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  37.27 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  34.38 
 
 		 210 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0263  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.78 
 
 		 468 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal  0.0177919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4947  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 469 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669147  hitchhiker  0.0000241398 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  36.61 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  36.44 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  33.93 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1320  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 460 aa  72  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  33.6 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.13 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0666  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0287  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 462 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.378858 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2371  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  33.93 
 
 		 212 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1661  response regulator receiver  31.97 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.725823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 210 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 241 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  31.97 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 199 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  31.36 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 210 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  36.61 
 
 		 212 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  70.5  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 214 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0113  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.272243  hitchhiker  0.000410564 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.05 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0593  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.858162  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3675  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.241682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0278  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 468 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.93 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.39 
 
 		 1483 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  33.04 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  32.17 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5458  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.11 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0682828  normal  0.0164406 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3732  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>