More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1466 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  100 
 
 		 131 aa  261  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3868  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 130 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 211 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 202 aa  92  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 208 aa  92  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 209 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 117 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  45.95 
 
 		 212 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  41.07 
 
 		 209 aa  87.8  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.05 
 
 		 209 aa  87.4  5e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 218 aa  87.4  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 210 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 207 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  47.52 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  40.91 
 
 		 218 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  44.14 
 
 		 200 aa  86.3  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 216 aa  85.9  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  43.24 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 209 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  39.84 
 
 		 204 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 203 aa  85.1  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 203 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 201 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 240 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.95 
 
 		 213 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 217 aa  84.3  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 207 aa  84  7e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 233 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  36.13 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  42.73 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  38.66 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  34.51 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 224 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  42.73 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  39.25 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  41.03 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  42.31 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.2 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 213 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 210 aa  80.9  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 219 aa  80.5  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  42.72 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 208 aa  80.1  0.000000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 201 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  39.06 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  37.84 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  37.39 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  38.6 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  35.34 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  43.64 
 
 		 136 aa  79  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 214 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.74 
 
 		 205 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  37.5 
 
 		 228 aa  77.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 207 aa  76.6  0.00000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  40 
 
 		 133 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  38.98 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.64 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  39.09 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 140 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 212 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 2137 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2980  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 137 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>