More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0232 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  244  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  77.5 
 
 		 122 aa  181  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  77.5 
 
 		 122 aa  179  1e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  44.74 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  42.37 
 
 		 212 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 212 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  41.53 
 
 		 212 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 208 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 220 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 209 aa  93.2  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  44.92 
 
 		 218 aa  92  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 209 aa  92  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.61 
 
 		 230 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 256 aa  91.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  44.72 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 122 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.74 
 
 		 212 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 212 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 230 aa  90.5  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 117 aa  90.1  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 330 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 208 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.02 
 
 		 228 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  38.66 
 
 		 200 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.15 
 
 		 220 aa  89  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 137 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 216 aa  87  7e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 201 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 201 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  42.28 
 
 		 136 aa  86.7  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  41.18 
 
 		 228 aa  86.7  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 202 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 214 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 224 aa  84.7  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 206 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 224 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  40 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  43.7 
 
 		 210 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 207 aa  84.3  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 241 aa  84.3  5e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  36.13 
 
 		 209 aa  84.3  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 212 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  83.6  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 207 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  83.6  8e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 210 aa  83.6  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 211 aa  83.6  9e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 442 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  42.02 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.84 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 330 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  45.3 
 
 		 131 aa  83.2  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 233 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  37.19 
 
 		 219 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  39.67 
 
 		 250 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  38.84 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.67 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  40.34 
 
 		 330 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  39.83 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 240 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2491  LuxR response regulator receiver  39.32 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000456787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  36.75 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  44.54 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 277 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 183 aa  80.1  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  38.26 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  36.97 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.35 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  39.84 
 
 		 246 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  42.86 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  42.02 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>