More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6855 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  245  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  65.81 
 
 		 120 aa  159  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  66.67 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  58.97 
 
 		 123 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  51.89 
 
 		 130 aa  102  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  48.18 
 
 		 204 aa  95.1  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 256 aa  94  6e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  43.33 
 
 		 206 aa  94  6e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  42.74 
 
 		 209 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  45.13 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  46.55 
 
 		 123 aa  89.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  44.04 
 
 		 122 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 131 aa  88.6  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 207 aa  88.2  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  47.17 
 
 		 121 aa  88.2  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 208 aa  87.8  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 208 aa  87.4  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  43.52 
 
 		 122 aa  87  7e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  41.44 
 
 		 212 aa  85.9  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 213 aa  85.1  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 209 aa  84.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 219 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5632  response regulator receiver protein  38.33 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.653856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  38.94 
 
 		 202 aa  83.6  8e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  44.35 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  42.34 
 
 		 210 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  44.14 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 215 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2318  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 125 aa  80.9  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  37.72 
 
 		 277 aa  80.5  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  40.54 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.64 
 
 		 220 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 123 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.32 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 240 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 224 aa  80.1  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000207768 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 224 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  40.71 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.71 
 
 		 215 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  39.82 
 
 		 210 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 221 aa  77.4  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 211 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  44.14 
 
 		 215 aa  77.8  0.00000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 212 aa  77.4  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 207 aa  77  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  42.48 
 
 		 204 aa  77  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 209 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  36.07 
 
 		 210 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  42.48 
 
 		 206 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 210 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  38.05 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  39.82 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  39.82 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 229 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.17 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  37.17 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7266  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>