More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0844 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  262  1e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  57.14 
 
 		 122 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  57.39 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6855  response regulator receiver protein  52.54 
 
 		 124 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.508442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  46.96 
 
 		 204 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  49.57 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5521  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 120 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0747322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  41.73 
 
 		 224 aa  106  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  48.7 
 
 		 256 aa  105  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 208 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  43.97 
 
 		 209 aa  103  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 220 aa  104  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 209 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  42.98 
 
 		 212 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 233 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.61 
 
 		 213 aa  100  5e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 215 aa  100  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 208 aa  99.8  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 277 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  39.34 
 
 		 219 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 212 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 214 aa  98.6  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.86 
 
 		 212 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  41.88 
 
 		 129 aa  97.8  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 228 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 215 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 224 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  44.07 
 
 		 123 aa  97.1  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 209 aa  96.7  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 230 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 209 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  41.96 
 
 		 210 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  37.8 
 
 		 212 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 128 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  43.86 
 
 		 122 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 213 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  42.74 
 
 		 214 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  42.11 
 
 		 202 aa  94.7  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1621  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 211 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.171805  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 212 aa  95.1  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 230 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.79 
 
 		 211 aa  95.1  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.24135  normal  0.0521212 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  44.86 
 
 		 210 aa  94.4  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.1 
 
 		 221 aa  94.7  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 213 aa  94.4  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 206 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 207 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  44.55 
 
 		 212 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  44.54 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  39.17 
 
 		 216 aa  94.4  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  45.69 
 
 		 240 aa  94.4  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 212 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 206 aa  93.2  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  42.98 
 
 		 122 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 218 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 207 aa  92.8  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  43.7 
 
 		 204 aa  93.2  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3400  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 201 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 210 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.53 
 
 		 207 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  43.64 
 
 		 212 aa  92.8  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 214 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  92  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  92  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  42.61 
 
 		 250 aa  92  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  41.88 
 
 		 212 aa  92  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 214 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 214 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 203 aa  92.4  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  39.37 
 
 		 214 aa  92.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 219 aa  92.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  40.83 
 
 		 215 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.73 
 
 		 214 aa  91.7  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 212 aa  91.7  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 224 aa  91.3  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 214 aa  91.3  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  38.46 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.66 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  91.3  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 214 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>