More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1551 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  100 
 
 		 277 aa  567  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0231  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  0.456368 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5241  LuxR family DNA-binding response regulator  38.72 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5151  response regulator receiver protein  38.27 
 
 		 330 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.347676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5548  DNA-binding response regulator, LuxR family  56.91 
 
 		 212 aa  135  5e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1268  two component LuxR family transcriptional regulator  49.62 
 
 		 220 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5088  LuxR response regulator receiver  56.03 
 
 		 212 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5502  two component response regulator  52.59 
 
 		 212 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.39 
 
 		 212 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2459  two component LuxR family transcriptional regulator  54.46 
 
 		 215 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  49.58 
 
 		 219 aa  126  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3511  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.14 
 
 		 209 aa  125  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.42 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 220 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 230 aa  123  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 212 aa  121  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  45 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.72 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1685  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.96 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166103  normal  0.907447 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3839  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.75 
 
 		 210 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.287356  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  48.31 
 
 		 204 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  48.72 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0181  two component LuxR family transcriptional regulator  47.9 
 
 		 210 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  48.72 
 
 		 212 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00709  nodulation protein  47.46 
 
 		 200 aa  117  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00695869  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5152  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.5 
 
 		 207 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.341934  normal  0.483556 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7267  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 217 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  51.75 
 
 		 206 aa  115  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3713  two component LuxR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.222966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.37 
 
 		 213 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 214 aa  113  4.0000000000000004e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2400  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.86 
 
 		 210 aa  112  5e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2279  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  46.61 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 214 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 214 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.28 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 219 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2682  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.52 
 
 		 222 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  46.61 
 
 		 206 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6169  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.96 
 
 		 221 aa  108  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  40.44 
 
 		 226 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 224 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4615  two component LuxR family transcriptional regulator  44.92 
 
 		 218 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2380  response regulator receiver protein  50.91 
 
 		 208 aa  105  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 241 aa  105  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  42.86 
 
 		 250 aa  105  9e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.12 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2317  two component LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 210 aa  103  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 208 aa  102  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 210 aa  102  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5318  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00034283  normal  0.590249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 224 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 209 aa  99.4  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 204 aa  99  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  41.94 
 
 		 183 aa  99  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5310  two component LuxR family transcriptional regulator  44 
 
 		 228 aa  98.6  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 201 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 216 aa  97.1  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  42.61 
 
 		 211 aa  97.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 210 aa  97.1  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3049  response regulator receiver  42.74 
 
 		 228 aa  97.1  3e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.651154  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5189  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 213 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.814448  normal  0.223105 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  96.3  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2356  response regulator receiver protein  42.98 
 
 		 215 aa  95.9  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.504321 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 122 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  40.35 
 
 		 123 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 117 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 256 aa  93.6  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  45.1 
 
 		 1010 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  41.82 
 
 		 214 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  42.11 
 
 		 212 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5185  two component LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 213 aa  93.2  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  40.68 
 
 		 214 aa  92.8  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  41.82 
 
 		 212 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.06 
 
 		 213 aa  92.8  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 203 aa  92.8  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  38.6 
 
 		 202 aa  92.4  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 209 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 218 aa  92.4  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0844  response regulator receiver protein  42.2 
 
 		 130 aa  92  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1597  response regulator transcription regulator protein  38.21 
 
 		 210 aa  92  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.395881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 202 aa  92  9e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  47.67 
 
 		 1001 aa  92  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  36.07 
 
 		 210 aa  92  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 208 aa  91.7  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>