More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1699 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1699  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 		 124 aa  249  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000935694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0646  response regulator receiver protein  59.02 
 
 		 128 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  53.39 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 214 aa  95.5  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 206 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  40 
 
 		 256 aa  90.9  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  40.18 
 
 		 209 aa  89.7  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 208 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  43.33 
 
 		 204 aa  87.8  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1553  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 212 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0872  two component LuxR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 210 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  84  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  41.27 
 
 		 212 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2139  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 213 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  40.18 
 
 		 214 aa  83.6  8e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.48 
 
 		 214 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0645  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 240 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  40 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  40.87 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0944  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  40.48 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2096  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.1 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  38.94 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 121 aa  82  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.52 
 
 		 216 aa  81.6  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  42.62 
 
 		 211 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 210 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 214 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  38.94 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  80.1  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 207 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  37.07 
 
 		 236 aa  80.1  0.000000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0232  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.156918  normal  0.401209 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4296  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1396  response regulator receiver  47.57 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3181  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.246114  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5186  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5090  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.159727  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  40.52 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 235 aa  78.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.21 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5187  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.24 
 
 		 230 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.209149 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.82 
 
 		 205 aa  79  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  40.52 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3969  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.966692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 210 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3571  two component transcriptional regulator  37.72 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2090  DNA-binding response regulator BvrR, putative  35.25 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0306093  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2010  putative DNA-binding response regulator BvrR  35.25 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.112651  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  40.71 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0828  two component transcriptional regulator  35.25 
 
 		 239 aa  78.6  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0815733  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2845  two component transcriptional regulator  35.96 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.868207 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.87 
 
 		 231 aa  78.6  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 229 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0255  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.84 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.02112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2997  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 150 aa  78.2  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  39.66 
 
 		 250 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0044  two component response regulator  35.59 
 
 		 240 aa  78.2  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  41.03 
 
 		 212 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1551  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 277 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.26584  hitchhiker  0.0028864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0612  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.6 
 
 		 228 aa  77.8  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.71 
 
 		 214 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  37.93 
 
 		 233 aa  77.4  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 218 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  38.79 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0873  response regulator receiver domain-containing protein  35.54 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  41.38 
 
 		 230 aa  77  0.00000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>