More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3868 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3868  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  260  4.999999999999999e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  41.54 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3793  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 218 aa  72  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  38.74 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  38.74 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 117 aa  68.6  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5502  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 136 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.020979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  37.84 
 
 		 202 aa  67  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  66.6  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5633  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.938686  normal  0.508699 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 		 1154 aa  65.9  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6901  response regulator receiver protein  32.76 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.279255  normal  0.546779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3866  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.44 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 246 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  35.9 
 
 		 204 aa  64.3  0.0000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 250 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 199 aa  63.9  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  32 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  33.04 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2407  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.51 
 
 		 220 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.958584 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  31.54 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1769  response regulator receiver protein, CheY  34.78 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  34.82 
 
 		 705 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 209 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2406  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88187 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4630  two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 235 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0961185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2399  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 211 aa  60.5  0.000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5693  two component LuxR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 224 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.247452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2505  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.382458  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2357  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.274737  normal  0.453516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0766  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  31.78 
 
 		 477 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0481028  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  32.52 
 
 		 1956 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.41 
 
 		 466 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2884  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.538425 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  30.33 
 
 		 1989 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02672  hypothetical protein  33.33 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6902  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.91 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.173656  normal  0.571333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0552  two component transcriptional regulator, winged helix family  38.53 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0182  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.622103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0499  response regulator receiver domain-containing protein  31.37 
 
 		 473 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.021061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00584  response regulator  33.33 
 
 		 467 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0042  LuxR family DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  28.93 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3488  nitrogen metabolism transcriptional regulator, NtrC, Fis family  34.95 
 
 		 466 aa  58.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.0666939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8520  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.697367 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1364  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 485 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6853  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.5 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.64 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.46 
 
 		 704 aa  58.5  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0038  LuxR family DNA-binding response regulator  33.93 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6495  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.653682  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2541  nitrogen regulation protein NR(I)  31.43 
 
 		 470 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001908  nitrogen regulation protein NR(I)  32.35 
 
 		 467 aa  58.2  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1518  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  38.24 
 
 		 767 aa  58.2  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0706082  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 806 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  32.43 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4618  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2242  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.33 
 
 		 464 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.719582 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5742  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.505537  normal  0.963827 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2381  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2619  two component transcriptional regulator  37.62 
 
 		 240 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.36 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4602  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  32.74 
 
 		 396 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0791  response regulator receiver domain-containing protein  31.19 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00778943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1614  two component LuxR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 221 aa  57.4  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3858  two component LuxR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0335499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0831  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.310785  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>