More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8084 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  249  8.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  63.39 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  63.39 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0401  response regulator receiver protein  58.41 
 
 		 129 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  60 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3890  response regulator receiver protein  57 
 
 		 184 aa  122  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  48.72 
 
 		 203 aa  100  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  47.79 
 
 		 207 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  37.61 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  34.4 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  38.6 
 
 		 216 aa  90.9  5e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  41.53 
 
 		 202 aa  88.6  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  38.05 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 210 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  38.1 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  43.3 
 
 		 130 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 201 aa  86.3  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  35.78 
 
 		 210 aa  86.7  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 209 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  39.5 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0534  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 200 aa  85.5  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 218 aa  85.5  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 210 aa  85.9  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 202 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.54 
 
 		 212 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 208 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09690  putative two-component response regulator  40.57 
 
 		 214 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000807943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0903  putative two-component response regulator  40.57 
 
 		 212 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.96795  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 214 aa  84.3  5e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  41.23 
 
 		 210 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0478  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 200 aa  83.6  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 210 aa  84  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0451  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 200 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3862  response regulator receiver protein  39.5 
 
 		 200 aa  83.6  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 201 aa  83.6  8e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3815  response regulator receiver protein  40.57 
 
 		 212 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 203 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  37.74 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0467  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25360  Response regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 246 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  37.17 
 
 		 204 aa  80.9  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 206 aa  80.9  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2166  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.51 
 
 		 220 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2210  two component LuxR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 208 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.891166  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  38.83 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  35 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0241  LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 216 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  39.47 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 208 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1644  two component LuxR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 207 aa  77.8  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0578076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 202 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  37.17 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0609  two component LuxR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 199 aa  77  0.00000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5150  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.56838 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2593  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.71 
 
 		 214 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.382122  hitchhiker  0.00235574 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 202 aa  77  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5456  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.94 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154935  hitchhiker  0.00976207 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.05 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  35.78 
 
 		 200 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2871  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.313361  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1472  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 214 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.781461 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  34.21 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  35.4 
 
 		 198 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2049  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5445  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 201 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.172889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2176  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116055  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2139  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  35.85 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  33.98 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>