More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1743 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  100 
 
 		 129 aa  261  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  37.01 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 		 130 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  42.37 
 
 		 131 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  42.24 
 
 		 120 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  39.83 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  37.74 
 
 		 124 aa  84.3  6e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  43.44 
 
 		 125 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  39.2 
 
 		 130 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  37.93 
 
 		 131 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 120 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  39.13 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  35.94 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  38.33 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 210 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0401  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 203 aa  70.1  0.000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.68 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3890  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.173819 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  38.32 
 
 		 1483 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.36 
 
 		 213 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  36.44 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1878  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 208 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  36.36 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5296  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3850  two component LuxR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  35.04 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2977  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.286368 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0873  response regulator receiver domain-containing protein  35.25 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  37.25 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 216 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1249  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 452 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6678  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 206 aa  64.3  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1499  LuxR family two component transcriptional regulator  32.81 
 
 		 209 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  33.04 
 
 		 204 aa  63.5  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  31.36 
 
 		 205 aa  63.9  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  39.25 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 121 aa  62.4  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.25 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5743  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.15 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4561  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 446 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7459  nodulation protein W, two-component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 219 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 210 aa  62  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2399  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.635003 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  33.96 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4458  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 442 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.741172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  30.65 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0732  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 215 aa  60.8  0.000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.298469  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  32.11 
 
 		 203 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 201 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2568  response regulator protein  32.46 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0467638  hitchhiker  0.0000000292578 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3910  two component LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1546  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0280611  normal  0.028816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003036  tetrathionate reductase two-component response regulator  33.64 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0588  Fis family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3610  two component LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5346  two component LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0593225  normal  0.752943 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  30.58 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3460  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.83 
 
 		 444 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0376131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  34.65 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3516  two component LuxR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584359  normal  0.0331166 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1301  LuxR response regulator receiver  31.09 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.549132  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2250  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  30.17 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0637  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000059529 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4689  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 447 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.338732 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  28.21 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  35.19 
 
 		 131 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5088  two component LuxR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.685625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2148  helix-turn-helix, Fis-type  35.34 
 
 		 442 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.383237 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3480  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000540997  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3169  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.254755  normal  0.187976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0317  LuxR family DNA-binding response regulator  31.9 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0309445  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>