More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2580 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  100 
 
 		 133 aa  257  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  65.57 
 
 		 135 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  71.31 
 
 		 125 aa  149  8.999999999999999e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  44.86 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 214 aa  80.5  0.000000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  36.28 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  36.15 
 
 		 136 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 201 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  38.64 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  40.35 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.11 
 
 		 213 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 203 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.98 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 210 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  40.83 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  42.98 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  38.74 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  37.29 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  43.14 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 202 aa  73.9  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2343  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 138 aa  73.2  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 130 aa  72.4  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  36.07 
 
 		 205 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  39.34 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 256 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  38.84 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  39.25 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  37.19 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.82 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2967  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  36.21 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5691  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5182  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.468487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2885  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.514979 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  37.29 
 
 		 213 aa  67.4  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4282  two component LuxR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 217 aa  67.4  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  35.66 
 
 		 203 aa  67  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 137 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4620  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 117 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  39.58 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  34.48 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.06 
 
 		 213 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  35.71 
 
 		 1483 aa  63.9  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  63.9  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1519  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.79 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.444774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2406  response regulator receiver domain-containing protein  35.64 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 212 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2579  response regulator FixJ  38.18 
 
 		 205 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5088  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1545  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.67 
 
 		 218 aa  63.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0982964  normal  0.0521608 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3179  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00699153  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  30.97 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  36.89 
 
 		 199 aa  62  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2996  LuxR response regulator receiver  29.55 
 
 		 198 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.05 
 
 		 708 aa  61.6  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 131 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0943  two component LuxR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 214 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1135  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 201 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.564331  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  34.11 
 
 		 204 aa  62  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6166  response regulator receiver protein  31.58 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 208 aa  61.2  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3082  two component LuxR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0470395  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  34.23 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5523  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2455  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1220  response regulator receiver domain-containing protein  34.78 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000878383 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  33.91 
 
 		 204 aa  60.5  0.000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2681  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4294  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 461 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595978 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 210 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 203 aa  60.1  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>