More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2118 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_2118  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  244  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  75.41 
 
 		 135 aa  171  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  71.31 
 
 		 133 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 203 aa  98.6  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  42.28 
 
 		 130 aa  97.1  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  96.7  9e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  45.3 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  47.01 
 
 		 205 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 202 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1743  response regulator receiver protein  44.26 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.961506 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  42.61 
 
 		 205 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  38.71 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  38.94 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 201 aa  90.9  6e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3240  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 207 aa  90.1  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.989265 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2117  response regulator FixJ  44.74 
 
 		 205 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  41.74 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 214 aa  87.8  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1363  response regulator FixJ  39.66 
 
 		 205 aa  87.8  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 210 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  87.4  6e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  39.82 
 
 		 204 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  41.88 
 
 		 204 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  40.65 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3728  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 		 205 aa  83.6  9e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  37.82 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4053  response regulator FixJ  39.34 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 256 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  40.48 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3729  two component LuxR family transcriptional regulator  37.07 
 
 		 209 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0582  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.812865 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1028  response regulator FixJ  40.52 
 
 		 205 aa  81.3  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4219  two component LuxR family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 212 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.186755  normal  0.698621 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  43.52 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1906  response regulator FixJ  39.5 
 
 		 205 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.700153  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4294  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 461 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.595978 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2536  two component regulator  36.89 
 
 		 204 aa  80.1  0.000000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.378867 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.47 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2567  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0907  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 202 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.285724  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 213 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  38.33 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68250  two-component response regulator  41.23 
 
 		 462 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371358  normal  0.144717 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1598  response regulator receiver domain-containing protein  40.5 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0917565  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4938  helix-turn-helix, Fis-type  40 
 
 		 463 aa  78.2  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 216 aa  78.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  36.21 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3108  LuxR response regulator receiver  38.02 
 
 		 202 aa  77.8  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.786061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1267  response regulator receiver protein  35.77 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0245  response regulator receiver protein  35.54 
 
 		 202 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0845  response regulator receiver protein  37.9 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5399  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  39.13 
 
 		 461 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5905  two-component response regulator  40.35 
 
 		 462 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1500  Signal transduction histidine kinase (STHK) with CheB and CheR activity  42.24 
 
 		 1483 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  77  0.00000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  36.13 
 
 		 209 aa  77  0.00000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4101  two component LuxR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 229 aa  77  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.878116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2452  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1779  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.264941  hitchhiker  0.00228897 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1719  response regulator receiver  35.59 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760885  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2160  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.563306  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  37.07 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1862  LuxR family DNA-binding response regulator  39.64 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340696  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3199  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.529866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1194  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  0.892025 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4947  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 469 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.669147  hitchhiker  0.0000241398 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4961  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.373586  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  40.2 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2130  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 207 aa  75.9  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.281977  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3192  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.97 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.513085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 204 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3982  two component LuxR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0179399 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1655  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  37.1 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.2 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2127  two component LuxR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.583598  normal  0.797665 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.293905  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1723  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0901353  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2614  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.37823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1505  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2748  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2232  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.97455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3087  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2670  LuxR family DNA-binding response regulator  38.39 
 
 		 212 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0263  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40 
 
 		 468 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.513605  normal  0.0177919 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1131  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 212 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0589444  normal  0.612677 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1539  two component LuxR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.274992 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5742  response regulator receiver protein  34.4 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2157  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>