More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2343 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2343  response regulator receiver protein  100 
 
 		 138 aa  281  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2461  response regulator receiver protein  63.36 
 
 		 132 aa  165  2e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2460  response regulator receiver protein  56.41 
 
 		 131 aa  129  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.732516  normal  0.518565 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2967  response regulator receiver protein  45 
 
 		 147 aa  106  9.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.135716 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2787  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.058704  normal  0.0692516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3276  response regulator receiver protein  36.57 
 
 		 135 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1341  response regulator receiver  36.45 
 
 		 131 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 207 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1027  response regulator receiver  31.9 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0212  response regulator receiver domain-containing protein  37.07 
 
 		 137 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2580  response regulator receiver protein  40.59 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2344  two component LuxR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 208 aa  72  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6273  response regulator FixJ  33.05 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  0.544702 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1701  two component LuxR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1362  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4054  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4728  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1905  response regulator receiver domain-containing protein  31.73 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.558841  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2041  response regulator receiver protein  35.25 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.212509  hitchhiker  0.00400016 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1621  two component LuxR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3506  response regulator receiver  40.21 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.32714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2222  response regulator FixJ  34.71 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0446915  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5293  two component LuxR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3813  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.21 
 
 		 202 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0126561  normal  0.200699 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1086  response regulator receiver protein  38.61 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3714  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1466  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  37.96 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 476 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2968  two component LuxR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  67.8  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.138 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2460  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  67.4  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0828  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.81 
 
 		 232 aa  67.4  0.00000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.159677 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1123  Fis family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 202 aa  67  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1825  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.77 
 
 		 205 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0736095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2095  response regulator receiver protein  32.48 
 
 		 216 aa  67  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.79 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.520585  normal  0.188997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5240  response regulator  30.43 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2829  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1744  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.933486  normal  0.721753 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6108  response regulator receiver protein  35.11 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7251  response regulator receiver protein  36 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2866  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 120 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.216907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0790  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.31 
 
 		 466 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1616  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3389  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8084  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4126  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2249  two component LuxR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7014  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 		 781 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0400  two component LuxR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 202 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1832  two component LuxR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 208 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 501 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4727  response regulator FixJ  35.64 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6109  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0504113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1552  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0686  two component LuxR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  63.9  0.0000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1173  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.94 
 
 		 232 aa  63.9  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0343  response regulator receiver  34.26 
 
 		 232 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0811  two-component response regulator  29.82 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.184612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3275  response regulator FixJ  33.06 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1342  response regulator FixJ  37.5 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.400465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2358  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.119902  normal  0.5156 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1743  two component LuxR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5540  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0494649 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1975  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.26 
 
 		 236 aa  62  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.206633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1824  response regulator receiver protein  37.27 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0653482 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3796  two component LuxR family transcriptional regulator  34 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2530  two component transcriptional regulator  31.09 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.279936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2442  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 480 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0965  response regulator receiver protein  32.77 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00737627  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3517  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.751217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3697  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  33.98 
 
 		 240 aa  61.2  0.000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4200  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 678 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.679083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6677  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0961  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.67 
 
 		 1154 aa  60.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.544458  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4310  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.59 
 
 		 631 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.917762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0436  two component LuxR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 202 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4157  DNA-binding response regulator  31.03 
 
 		 202 aa  60.5  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3812  two component LuxR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.922787  normal  0.026414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  33.98 
 
 		 971 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5642  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.04 
 
 		 768 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  34.86 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4329  two component transcriptional regulator  34.26 
 
 		 236 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.077082  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0064  histidine kinase  38.02 
 
 		 598 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2741  two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.299643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2445  two component LuxR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2694  putative PAS/PAC sensor protein  32.04 
 
 		 969 aa  60.5  0.000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0176534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2788  response regulator FixJ  29.52 
 
 		 205 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0210669  normal  0.0766422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3551  LuxR family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.178316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2791  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.47 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0590322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2223  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0820  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.91 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2371  two component LuxR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.820742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1802  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 459 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0135454  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>