More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3814 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  100 
 
 		 127 aa  256  7e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0993  response regulator receiver protein  88.19 
 
 		 127 aa  230  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.250481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3669  response regulator receiver protein  36.52 
 
 		 127 aa  80.5  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4041  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.557093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  40 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5022  response regulator receiver protein  37.7 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1117  response regulator  36.92 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3092  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2017  response regulator CheY  34.21 
 
 		 129 aa  73.6  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0852  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.14 
 
 		 1055 aa  73.2  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  40 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  35.04 
 
 		 129 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 239 aa  72  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3065  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 128 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.735156  hitchhiker  0.0000890784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  36.84 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2618  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.17 
 
 		 453 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0380  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 522 aa  70.5  0.000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0200588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3471  response regulator receiver protein  35.59 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.455069  normal  0.215612 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3095  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  37.27 
 
 		 226 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0654926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0905  response regulator receiver  37.27 
 
 		 226 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1111  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0272953  normal  0.304596 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3431  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  36.36 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  35.96 
 
 		 1122 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1503  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 513 aa  68.2  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0866  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 496 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555974  normal  0.133337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0965  two-component response regulator PilR  38.26 
 
 		 446 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.25964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2355  two component Fis family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 465 aa  67.8  0.00000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.658958  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3345  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 483 aa  67.4  0.00000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0939  response regulator receiver  37.27 
 
 		 226 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0896662 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0877  response regulator receiver/unknown domain-containing protein  35.45 
 
 		 226 aa  67  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.452942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0202  response regulator receiver protein  33.61 
 
 		 137 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0919  two component AraC family transcriptional regulator  37.27 
 
 		 356 aa  67  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0677  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  37.86 
 
 		 343 aa  66.6  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.756866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3100  response regulator  35.78 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2145  two component signal transduction response regulator  36.54 
 
 		 492 aa  66.2  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2709  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3203  response regulator receiver protein  31.53 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.14663  normal  0.77717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 129 aa  66.6  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29000  sigma54-dependent response regulator, two-component  37.72 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.99042  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  32.17 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1114  response regulator receiver modulated serine phosphatase  38.18 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6827  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 389 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  36.15 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0318  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 444 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.623728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2696  response regulator receiver protein  32.5 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1938  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5710  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase (bvgS-like)  37.27 
 
 		 1040 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3021  sporulation transcriptional activator Spo0A  33.06 
 
 		 264 aa  65.1  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000341276  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 862 aa  65.1  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3166  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.21 
 
 		 457 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.521221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  38.74 
 
 		 971 aa  65.1  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2693  response regulator  33.64 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0930  response regulator receiver  35.45 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2555  two-component response regulator PilR  35.59 
 
 		 459 aa  64.7  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.822177  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2655  response regulator receiver (CheY-like) modulated metal dependent phosphohydrolase  38.89 
 
 		 353 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60260  two-component response regulator PilR  37.21 
 
 		 445 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000831057 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0133  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.651583  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0823  type 4 fimbriae expression regulatory protein pilR  35.43 
 
 		 446 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1841  response regulator receiver protein  35.2 
 
 		 152 aa  64.3  0.0000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 		 501 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2940  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.7 
 
 		 502 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2764  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 466 aa  63.9  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3630  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 502 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.670707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1498  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 500 aa  64.3  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2678  two component, sigma-54 specific, Fis family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 457 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4153  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.91 
 
 		 466 aa  63.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.11717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3323  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.46 
 
 		 458 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.581416  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1179  two component AraC family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 359 aa  63.9  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1967  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5187  two-component response regulator PilR  37.39 
 
 		 445 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1854  histidine kinase  39.42 
 
 		 1111 aa  63.9  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.131557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1789  response regulator receiver protein  33.91 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34666  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0460  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.903697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0504  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 443 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0722  helix-turn-helix, Fis-type  34.75 
 
 		 445 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4840  two-component response regulator PilR  37.39 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  0.760188 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03337  putative response regulator with Chemotaxis-specific methylesterase domain  30.43 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2103  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 467 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.705186  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1973  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00115006  hitchhiker  0.0000141072 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0874  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0123  DNA-binding response regulator  36.75 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0537  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.41 
 
 		 446 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 379 aa  62.8  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0958  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.26 
 
 		 513 aa  62  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1263  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0520  two component response regulator  35.48 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04881  two-component system regulatory protein  33.9 
 
 		 466 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.476586  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3147  response regulator receiver protein  36.07 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1442  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0140  two component transcriptional regulator  31.19 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.794843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0533  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.41 
 
 		 443 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.141325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>