More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_0133 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_0133  response regulator receiver protein  100 
 
 		 115 aa  231  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.651583  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1660  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1591  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 266 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2553  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1194499999999997e-20 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1956  two component transcriptional regulator  35.59 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000121146  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0109  response regulator receiver  35.59 
 
 		 225 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000662688  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0930  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000284085  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3356  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 484 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2563  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 		 935 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.851477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  35.83 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  32.76 
 
 		 1122 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3157  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 266 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6438  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.17 
 
 		 394 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00615091  normal  0.383003 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2946  DNA-binding heavy metal response regulator  38.02 
 
 		 223 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  33.04 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2258  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 468 aa  71.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428008  normal  0.0222917 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0146  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 219 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1381  response regulator receiver protein  36.97 
 
 		 265 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01714  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain protein  31.93 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  35.71 
 
 		 196 aa  70.1  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1965  response regulatory protein, sigma 54 related  35.54 
 
 		 384 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0275961  normal  0.129103 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0549  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 265 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3481  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 265 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3745  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.05 
 
 		 1010 aa  69.7  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.412805  hitchhiker  0.00597184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2310  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.6 
 
 		 469 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294968  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  28.81 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1555  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 467 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.21045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3862  histidine kinase  36.44 
 
 		 1384 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3353  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000371413  normal  0.100473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1017  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 460 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0996419 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000474  chemotaxis protein CheC -- inhibitor of MCP methylation  33.91 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2398  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.6 
 
 		 469 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.313034  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4464  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 945 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2811  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 498 aa  69.7  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.782124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0229  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.04 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.069189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 		 811 aa  68.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1860  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  36.07 
 
 		 938 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0659  response regulator receiver  31.36 
 
 		 265 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2920  response regulator receiver protein  35.09 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.525877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3317  two component transcriptional regulator  34.21 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3627  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  36.75 
 
 		 721 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0775  response regulator receiver protein  43.27 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0246849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2519  sigma-54 factor interaction domain-containing protein  34.75 
 
 		 468 aa  69.3  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.78 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0549  chemotaxis protein CheY/response regulator receiver domain-containing protein  31.36 
 
 		 267 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0846  response regulator receiver protein  38.32 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282438 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2499  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.96 
 
 		 448 aa  68.6  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0553938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1620  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000174219  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.03 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000154116  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2606  response regulator receiver protein  29.66 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.677486  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2412  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.96 
 
 		 448 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  32.35 
 
 		 440 aa  68.2  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0337  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06228  hypothetical protein  33.04 
 
 		 334 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3324  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 265 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5047  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 387 aa  68.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1483  DNA-binding response regulator  35.09 
 
 		 226 aa  68.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1517  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  31.9 
 
 		 227 aa  67.8  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3564  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0923704 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 458 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1645  two component transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 526 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.168722  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1278  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 452 aa  67.4  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.902353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0555  response regulator receiver  30.17 
 
 		 266 aa  67.4  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.502991  normal  0.361132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 224 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  38.6 
 
 		 977 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1087  response regulator  33.04 
 
 		 334 aa  67.4  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.164702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6788  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.45 
 
 		 230 aa  67.4  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.241896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  36.44 
 
 		 1373 aa  67  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0528  two component heavy metal response transcriptional regulator  36.94 
 
 		 223 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6781  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  37.19 
 
 		 264 aa  67.4  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  28.21 
 
 		 401 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  36.7 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1545  response regulator receiver protein  29.03 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3211  histidine kinase  35.65 
 
 		 781 aa  67  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.306218  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1179  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0321  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1773  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.894508  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1842  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 227 aa  67  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02260  putative two-component response regulator  40.54 
 
 		 121 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.797803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2161  sensor histidine kinase/response regulator  35.04 
 
 		 1286 aa  67  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1988  response regulator receiver protein  33.03 
 
 		 119 aa  67  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 382 aa  67  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3520  chemotaxis regulatory protein CheY  28.81 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.387623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>