More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0987 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 		 919 aa  777    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  59.76 
 
 		 819 aa  976    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  100 
 
 		 938 aa  1942    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.33 
 
 		 793 aa  566  1e-160  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1397 aa  327  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.08 
 
 		 1202 aa  327  6e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  36.04 
 
 		 1064 aa  323  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1550 aa  311  4e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.1 
 
 		 921 aa  304  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.93 
 
 		 1442 aa  301  4e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  33.1 
 
 		 1255 aa  298  3e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.89 
 
 		 1369 aa  296  1e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 1005 aa  295  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.97 
 
 		 985 aa  295  3e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.22 
 
 		 923 aa  294  5e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 1363 aa  292  2e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  33.62 
 
 		 1346 aa  292  2e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.91 
 
 		 1267 aa  290  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.91 
 
 		 2654 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1230 aa  288  4e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.43 
 
 		 1582 aa  287  7e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0627  histidine kinase  31.57 
 
 		 1200 aa  287  8e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  33.33 
 
 		 1177 aa  286  9e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  32.81 
 
 		 1014 aa  286  9e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.49 
 
 		 1310 aa  286  1.0000000000000001e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.81 
 
 		 727 aa  284  5.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.17 
 
 		 816 aa  284  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 1069 aa  283  1e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 812 aa  281  3e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1245 aa  281  4e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 		 1659 aa  280  8e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.88 
 
 		 1305 aa  280  8e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  35 
 
 		 1240 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.7 
 
 		 1313 aa  278  2e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  29.55 
 
 		 1417 aa  278  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.46 
 
 		 705 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.15 
 
 		 1397 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.59 
 
 		 1398 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5043  PAS  31.99 
 
 		 855 aa  276  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.563138  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3702  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 		 1234 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  32.12 
 
 		 914 aa  274  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  30.18 
 
 		 852 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 		 833 aa  272  2.9999999999999997e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.46 
 
 		 991 aa  271  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0538  ATP-binding region, ATPase-like protein  30.63 
 
 		 1233 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  31.61 
 
 		 847 aa  271  5.9999999999999995e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.51 
 
 		 1765 aa  270  7e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  31.03 
 
 		 1626 aa  270  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 		 1234 aa  269  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.881781  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 		 1057 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  30.43 
 
 		 977 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1042 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.73 
 
 		 1499 aa  268  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  28.95 
 
 		 1418 aa  267  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.93 
 
 		 1284 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 1316 aa  267  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 		 649 aa  266  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 		 1768 aa  266  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.3 
 
 		 1135 aa  265  3e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.79 
 
 		 1322 aa  265  4e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 		 990 aa  264  4.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.98 
 
 		 1266 aa  264  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 		 1090 aa  264  8e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1040 aa  263  8.999999999999999e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0576  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 1236 aa  263  1e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.18 
 
 		 1236 aa  263  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 		 745 aa  262  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3129  sensory box histidine kinase/response regulator  30.6 
 
 		 1236 aa  263  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0577  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 1236 aa  262  3e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3453  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.46 
 
 		 1236 aa  261  3e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 916 aa  261  6e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.33 
 
 		 929 aa  261  6e-68  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.64 
 
 		 950 aa  261  6e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  32.43 
 
 		 1763 aa  260  7e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2022  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.13 
 
 		 1258 aa  260  8e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.250401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  31.84 
 
 		 1021 aa  259  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.46 
 
 		 977 aa  260  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0577  sensory box histidine kinase/response regulator  30.46 
 
 		 1188 aa  259  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 		 925 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 		 1820 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  33.74 
 
 		 861 aa  259  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1767 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 		 1767 aa  258  3e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.1 
 
 		 1692 aa  258  4e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3604  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.32 
 
 		 1172 aa  257  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.23 
 
 		 876 aa  256  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  31.78 
 
 		 1030 aa  255  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.61 
 
 		 1548 aa  256  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0319  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  30.65 
 
 		 636 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.61 
 
 		 818 aa  255  3e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  33.21 
 
 		 891 aa  255  3e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0416  histidine kinase  32.73 
 
 		 896 aa  255  3e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1238 aa  255  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0537  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 		 1238 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0463  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.26 
 
 		 1314 aa  254  5.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.332875  normal  0.985136 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0621  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1309 aa  254  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.288255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.76 
 
 		 1118 aa  254  6e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.57 
 
 		 2035 aa  254  6e-66  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0141  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.34 
 
 		 778 aa  254  6e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.48 
 
 		 929 aa  254  7e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>