More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1040 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_1040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
819 aa  1693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0987  histidine kinase  59.47 
 
 
938 aa  1009    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.718308  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0907  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.26 
 
 
919 aa  729    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.651038 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1037  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.26 
 
 
793 aa  528  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0139  histidine kinase  38.12 
 
 
1064 aa  334  4e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
1397 aa  330  6e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
758 aa  315  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.96 
 
 
1442 aa  311  2.9999999999999997e-83  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3314  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.4 
 
 
1582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.660804  hitchhiker  0.0000234203 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.78 
 
 
1363 aa  305  3.0000000000000004e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1267 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.29 
 
 
1550 aa  302  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
921 aa  301  3e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1202 aa  301  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  34.52 
 
 
1177 aa  299  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02943  two-component system sensor protein  32.91 
 
 
727 aa  298  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00726909  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  34.28 
 
 
1255 aa  296  7e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  34.67 
 
 
1346 aa  293  7e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0240  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.08 
 
 
1005 aa  290  9e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  34.23 
 
 
923 aa  287  7e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.28 
 
 
1014 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4016  putative PAS/PAC sensor protein  30.83 
 
 
1626 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.95 
 
 
1369 aa  285  3.0000000000000004e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.94 
 
 
816 aa  283  6.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3011  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1436 aa  279  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.701044  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.44 
 
 
991 aa  278  2e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1069 aa  278  2e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1240 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0067  signal transduction histidine kinase-like protein protein  32.43 
 
 
1021 aa  277  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.39 
 
 
812 aa  277  7e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.08 
 
 
2654 aa  277  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2787  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.68 
 
 
909 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0319908  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3788  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.69 
 
 
1042 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1767 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.8 
 
 
1245 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.83 
 
 
1499 aa  275  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.27 
 
 
1767 aa  275  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10770  putative sensor/response regulator hybrid  30.72 
 
 
1417 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.903284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
705 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1768 aa  272  2e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 
1765 aa  271  4e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 
1316 aa  271  5e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0358  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.29 
 
 
1485 aa  270  5e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.4 
 
 
1767 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.24 
 
 
1426 aa  270  8e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  31.5 
 
 
1763 aa  270  8.999999999999999e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0678  ammonium transporter  31.8 
 
 
1322 aa  269  1e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.760367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.33 
 
 
1397 aa  269  2e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3164  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.84 
 
 
1245 aa  269  2e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.26571  hitchhiker  0.00125378 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2813  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
1632 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  32.19 
 
 
1135 aa  268  4e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1683  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
1659 aa  268  4e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0633  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 
1480 aa  268  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.461456  normal  0.141694 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
916 aa  267  5.999999999999999e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  33.46 
 
 
861 aa  267  7e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  33.59 
 
 
891 aa  266  8.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1284 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3706  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
738 aa  266  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1625 aa  266  1e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34990  integral membrane hybrid histidine protein kinase  33.39 
 
 
914 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.59 
 
 
852 aa  265  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2958  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
914 aa  265  2e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0730745  normal  0.010886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.83 
 
 
1771 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
1548 aa  265  2e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.03 
 
 
1305 aa  266  2e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
745 aa  265  2e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0981  putative sensor/response regulator hybrid  28.97 
 
 
1418 aa  265  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.195382  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.62 
 
 
1692 aa  264  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.38 
 
 
1118 aa  264  4.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0602  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 
1057 aa  263  8.999999999999999e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.862038  hitchhiker  0.00157552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  31.28 
 
 
1765 aa  263  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.21 
 
 
2035 aa  262  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
893 aa  262  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.85 
 
 
957 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.48 
 
 
933 aa  261  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  32.74 
 
 
929 aa  261  3e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1598  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.05 
 
 
964 aa  261  3e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.349888 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.68 
 
 
946 aa  259  1e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1392  PAS sensor protein  32.22 
 
 
977 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.802774  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.05 
 
 
1629 aa  259  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0413  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
649 aa  259  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.486331 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  31.58 
 
 
770 aa  259  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.84 
 
 
929 aa  258  2e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1398 aa  258  2e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0459  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.63 
 
 
1230 aa  258  3e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.328016  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2497  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.71 
 
 
948 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0147984  normal  0.803827 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.12 
 
 
1784 aa  258  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50630  Periplasmic hybrid histidine protein kinase, two-component  31.71 
 
 
1030 aa  258  3e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.366718  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1629 aa  258  5e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
876 aa  257  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3652  Signal transduction histidine kinase-like  33.03 
 
 
765 aa  257  6e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.471696  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2407  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.71 
 
 
948 aa  257  6e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000239257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
1782 aa  257  7e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.56 
 
 
1310 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1433 aa  256  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  31.92 
 
 
931 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2615  hybrid sensory kinase in two-component regulatory system with RcsB and YojN  32.71 
 
 
915 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.544475 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  33.39 
 
 
1574 aa  256  1.0000000000000001e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4645  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.24 
 
 
948 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
950 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>