More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1923 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2967  putative PAS/PAC sensor protein  44.03 
 
 
376 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3166  putative PAS/PAC sensor protein  44.63 
 
 
483 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
769 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0642  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
401 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.201186  normal  0.0191068 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 
931 aa  102  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1607  response regulator receiver domain-containing protein  38.28 
 
 
186 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.790082 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1026  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 
559 aa  101  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
984 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
980 aa  100  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0840  response regulator receiver domain-containing protein  41.8 
 
 
196 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.351248  normal  0.247104 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.28 
 
 
593 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
789 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 
637 aa  99.8  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.65 
 
 
1301 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2986  putative PAS/PAC sensor protein  40.15 
 
 
474 aa  99  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
656 aa  98.6  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.548294  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.81 
 
 
1078 aa  98.2  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  39.84 
 
 
440 aa  97.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1267  putative PAS/PAC sensor protein  41.86 
 
 
849 aa  97.1  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0446298  normal  0.4297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  42.62 
 
 
812 aa  97.1  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.35 
 
 
766 aa  97.1  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.371468  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 
524 aa  97.1  8e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.23 
 
 
1032 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1709  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 
669 aa  95.9  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0628445  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1643  response regulator receiver domain-containing protein  35.21 
 
 
200 aa  95.5  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.831648  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
603 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 
530 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
781 aa  94.4  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 
771 aa  94.4  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
753 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.20268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
1426 aa  94  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1245  putative PAS/PAC sensor protein  40.98 
 
 
400 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 
511 aa  93.6  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2107  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.04 
 
 
660 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0141  putative PAS/PAC sensor protein  37.31 
 
 
837 aa  92.8  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  decreased coverage  0.00355903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2388  response regulator receiver  36.07 
 
 
127 aa  93.2  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0389923  normal  0.541574 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
783 aa  92.8  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1649  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
550 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.181327  normal  0.670777 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2671  response regulator receiver domain-containing protein  38.81 
 
 
287 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 
765 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
2072 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
608 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.85 
 
 
763 aa  90.9  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.926751  normal  0.806541 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
862 aa  90.9  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
896 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
878 aa  90.5  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1962  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
603 aa  90.5  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1463  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.02 
 
 
768 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.103172  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
1439 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0015  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.69 
 
 
347 aa  89.7  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.84393  normal  0.0442191 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
657 aa  89  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1525  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
813 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
1039 aa  88.6  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1309  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.06 
 
 
472 aa  89.4  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.974547  normal  0.0144544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 
1425 aa  89  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1293  putative PAS/PAC sensor protein  35.61 
 
 
1265 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.307468 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  39.67 
 
 
906 aa  88.2  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
653 aa  87.4  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
1276 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  40.8 
 
 
764 aa  87.4  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
1253 aa  87.4  7e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
1513 aa  87.4  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.84 
 
 
886 aa  87  7e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0161  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
1039 aa  86.7  9e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 
1121 aa  85.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
619 aa  85.1  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2673  response regulator receiver domain-containing protein  36 
 
 
133 aa  85.5  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  32.28 
 
 
477 aa  84.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2366  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36 
 
 
901 aa  84.7  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.180969  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
1113 aa  84.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  33.58 
 
 
458 aa  84  6e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.43 
 
 
1325 aa  83.6  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.39 
 
 
873 aa  84  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2968  putative PAS/PAC sensor protein  36.89 
 
 
479 aa  83.6  8e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 
909 aa  83.6  8e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.53 
 
 
1111 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2636  signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
1051 aa  83.2  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0264  response regulator receiver domain-containing protein  35.97 
 
 
178 aa  82  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.38 
 
 
644 aa  82  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0332  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2385  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
720 aa  80.9  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.788418 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0872  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
500 aa  80.1  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.3427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 
596 aa  80.5  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2756  putative PAS/PAC sensor protein  35.9 
 
 
402 aa  79.7  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.482766 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 
758 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1167  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
544 aa  79  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.230477  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1470  response regulator receiver protein  36.76 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00118197  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
759 aa  78.2  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2604  response regulator receiver protein  36.13 
 
 
265 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000114543 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0217  response regulator receiver protein  39.81 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.410028  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2712  response regulator receiver protein  41.51 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2267  putative PAS/PAC sensor protein  37.27 
 
 
576 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0262742  normal  0.128517 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
1045 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 
120 aa  73.9  0.0000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  33.06 
 
 
461 aa  73.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0133  response regulator receiver protein  35.29 
 
 
115 aa  73.6  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.651583  hitchhiker  0.000285667 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2317  response regulator receiver protein  34.62 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.357454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
737 aa  72.8  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2887  response regulator receiver modulated serine phosphatase  39.81 
 
 
423 aa  72.8  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>