More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0286 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0286  response regulator receiver protein  100 
 
 		 125 aa  246  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0317  response regulator receiver protein  84.8 
 
 		 125 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7255  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4725  response regulator receiver protein  35 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4491  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.697305 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0301  two component LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.54347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0559  histidine kinase  28.7 
 
 		 1327 aa  58.5  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00477073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0407  response regulator receiver protein  30.51 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.177022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4953  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0356206 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0415  two component transcriptional regulator  29.84 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.777838 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1860  two component LuxR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 235 aa  57.4  0.00000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2987  LuxR family two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4743  response regulator receiver protein  31.67 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0708  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2789  response regulator receiver protein  30.43 
 
 		 121 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0237  response regulator receiver protein  34.23 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000555979 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2078  response regulator receiver modulated serine phosphatase  31.03 
 
 		 379 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.61197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2600  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.085671 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3020  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.447611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4151  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4125  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.23 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.125271  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2693  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4009  two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 230 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00751412  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1838  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1812  two component transcriptional regulator, LuxR family  29.73 
 
 		 231 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2900  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.197839  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3577  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.400966  normal  0.141746 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3567  phosphate regulon transcriptional regulatory protein phoB  37.5 
 
 		 228 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0608  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 398 aa  53.5  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  49.28 
 
 		 752 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  27.73 
 
 		 1306 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2385  response regulator receiver domain-containing protein  28.07 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.849023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0039  response regulator receiver protein  27.27 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0902  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.844306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2212  chemotaxis protein CheY  39.13 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  38.1 
 
 		 1156 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1580  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1725 aa  52.4  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0501  histidine kinase  38.03 
 
 		 955 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 		 1725 aa  52.8  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1605  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.76 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 1278 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4356  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.41 
 
 		 248 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.509549  n/a   
 
 
-
 
NC_013737  Slin_7056  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3513  response regulator receiver domain-containing protein  28.21 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.126367  normal  0.123274 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1573  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3788  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2955  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 231 aa  51.6  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.800941 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1431 aa  51.6  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3379  response regulator receiver protein  37.36 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.100114  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.93 
 
 		 1366 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3512  response regulator receiver domain-containing protein  31.01 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.592796  normal  0.130265 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3155  adenylate/guanylate cyclase  27.97 
 
 		 1172 aa  51.6  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.386213  hitchhiker  0.00095291 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6237  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 721 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  48.28 
 
 		 793 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  48.28 
 
 		 789 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2781  response regulator receiver protein  31.94 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  46.55 
 
 		 764 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1491  two component transcriptional regulator  28.1 
 
 		 236 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00391258 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3872  histidine kinase  28.07 
 
 		 1373 aa  51.2  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0459124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4333  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  29.41 
 
 		 248 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1356  response regulator receiver domain-containing protein  26.45 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4201  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 262 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1372  response regulator receiver domain-containing protein  26.45 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0313107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 781 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3187  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0550  histidine kinase  32.88 
 
 		 1388 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.23656  normal  0.89256 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2338  GAF sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.48 
 
 		 1180 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0263037  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 755 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4261  DNA-binding response regulator  38.55 
 
 		 233 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4627  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.94 
 
 		 226 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4625  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 121 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.635313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3248  response regulator receiver  27.19 
 
 		 148 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.264895  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.31 
 
 		 989 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1137  response regulator receiver domain-containing protein  29.46 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.635456 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0031  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.25 
 
 		 229 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2404  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 119 aa  50.4  0.000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.190427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4350  response regulator receiver modulated PilZ sensor protein  43.66 
 
 		 248 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767241  normal  0.344464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1319  response regulator receiver protein  40.3 
 
 		 129 aa  50.4  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 762 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0055  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.84 
 
 		 229 aa  50.1  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5184  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 		 939 aa  50.4  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584953  normal  0.0776559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 767 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 		 765 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4695  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.08 
 
 		 526 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.756017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2827  two component transcriptional regulator  25.66 
 
 		 230 aa  49.7  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0056  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000725059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3975  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.8 
 
 		 811 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000222358  hitchhiker  0.00723661 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4702  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 381 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0901362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0750  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4303  two component transcriptional regulator  30.84 
 
 		 229 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.205089  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0792  histidine kinase  34.25 
 
 		 1378 aa  50.1  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.85 
 
 		 1165 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.985282 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  46.55 
 
 		 764 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  46.55 
 
 		 769 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0332  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 806 aa  49.7  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112355  normal  0.937153 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0765  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 125 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.626658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1659  two component transcriptional regulator  36.36 
 
 		 245 aa  50.1  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0722  response regulator receiver protein  35.62 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2073  nitrogen metabolism transcriptional regulator NtrC  31.9 
 
 		 502 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>